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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 测序结果怎么看对不对啊
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表弟爱网游

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香，分子生物期待您更多精彩。 2015-09-22 12:11:04
我以前在测序公司上班，测序的人只负责你送来的样品，不会关心你的样品是什么，也不知道你的样品的信息。建议你单向测序，是反向测不过去，有特殊结构；至于结果没测好，原因有好几个：样品问题，引物问题，操作问题和机器问题。机器如果出问题，那出错的不止影响你一个人的结果，很容易被查出来，操作问题一般会被发结果的人看出来，也就不会发给你，当然有极小的情况没看出来，这是要扣工资的。所以一般都是样品问题或者引物有问题，好好确认下你的样品，和送的测序引物，然后问下你们老板，你的目的基因是不是有什么特殊结构。希望打这么多字能帮助到你一点。
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当一切如飞舞的落叶坠落，惋惜之余，也要学会原谅与释怀
11楼2015-09-22 09:29:18
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ddj12138

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香，分子生物期待您更多精彩。 2015-09-22 12:11:11
因为DNA是双链结构    单向测序就是只测了一条正向的  内含子一般是不编码氨基酸的  只有外显子才会编码
你可以去Genbank上查找你测的这个序列  看一下你扩增的是什么  另外DNAMAN也可以做碱基和氨基酸的比对  而且是在一个阅读框里
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12楼2015-09-22 09:45:59
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xy531483760

金虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by HX91926 at 2015-09-22 08:30:12
信号肽也是要表达的啊，具体我不懂，打断了能接起来吗？主要这是在原核体内
...

我记得最后一步是测信号肽的，然后就有个切除的序列，你就要记录下来这段肽的序列。就没了这是我做的

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比较笨的小虫虫
13楼2015-09-22 10:16:07
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HX91926

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 表弟爱网游 at 2015-09-22 09:29:18
我以前在测序公司上班，测序的人只负责你送来的样品，不会关心你的样品是什么，也不知道你的样品的信息。建议你单向测序，是反向测不过去，有特殊结构；至于结果没测好，原因有好几个：样品问题，引物问题，操作问题 ...

嗯多谢，老板生化的，整个重组质粒都是公司做的，不是他做的，我问问他知不知道，然后送样因为没有相关药品，直接送的菌液，同样公司做的，没有引物，是per质粒，测序公司说没有引物也可以，是他们提供的引物

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14楼2015-09-22 10:24:14
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HX91926

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by ddj12138 at 2015-09-22 09:45:59
因为DNA是双链结构    单向测序就是只测了一条正向的  内含子一般是不编码氨基酸的  只有外显子才会编码
你可以去Genbank上查找你测的这个序列  看一下你扩增的是什么  另外DNAMAN也可以做碱基和氨基酸的比对  而且 ...

对啊，那，两个阅读况之间的是内含子吗？

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15楼2015-09-22 10:34:17
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HX91926

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by xy531483760 at 2015-09-22 10:16:07
我记得最后一步是测信号肽的，然后就有个切除的序列，你就要记录下来这段肽的序列。就没了这是我做的
...

这先不管了，阅读况之间的是内含子吗？

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16楼2015-09-22 10:35:32
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xy531483760

金虫 (小有名气)
不知道，感觉是外显子

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比较笨的小虫虫
17楼2015-09-22 12:00:18
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xy531483760

金虫 (小有名气)
不知道，感觉是外显子

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比较笨的小虫虫
18楼2015-09-22 12:01:03
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蓝索道人

木虫 (正式写手)
如果你需要的真核蛋白在NCBI上有，你直接找你需要的物种的mRNA，找到CDS，看看表达序列是从多少到多少，然后设计引物，提取mRNA，PCR得到片段，酶切，连接，转化，菌落PCR筛选，送测序后，再转化到表达菌中。不知道你的测序是送的什么？

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努力就有收获！
19楼2015-09-22 13:15:27
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MHSW

禁言 (正式写手)
感谢参与，应助指数 +1
本帖内容被屏蔽
20楼2015-09-22 14:50:56
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