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HX91926

铜虫 (小有名气)

[求助] 测序结果怎么看对不对啊 已有7人参与

小弟导师做生物化学的,然后需要用几个真核蛋白,于是就转到大肠杆菌里,不表达。
导师说基因是人家处理过的,公司处理的可以在原核表达,公司怎么处理我就不知道了。
于是我就送去测了个序,公司说只有正向成功了,反向不成功,要单向测,我也不懂,就说好。
于是想先把送回来这个正向的看看。在线做的ncbi blast和开放阅读框不太明白。

不明白的是
1.这个开放阅读框最大的也才80个氨基酸,那应该是不太对把,比对结果是与mrna相似,应该是去掉内含子的,那怎么这样?
2,每个阅读框的起始为什么不是甲硫氨酸?起始是怎么算的?
3.blast比对结果具体怎么看,貌似相似度挺高的,有没有可能是一两个基因不对,就不表达?
会不会是测序问题,等单向测序出来了可能就不是这个结果了

测序结果怎么看对不对啊
搜狗截图20150921172104.png


测序结果怎么看对不对啊-1
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测序结果怎么看对不对啊-2
搜狗截图20150921185622.png
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xy531483760

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by HX91926 at 2015-09-22 08:13:25
我这个蛋白绝对有几百个氨基酸,八十怎么可能正常?细菌内没有去除内含子的机智,阅读况中间的是内含子吗?可是又与mrna序列比对相似,所以是不是啊,好奇怪
...

(?>ω<*?)那是不是被打断了啊

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比较笨的小虫虫
9楼2015-09-22 08:20:15
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xy531483760

金虫 (小有名气)

有,原理我不清楚,我只会做

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比较笨的小虫虫
3楼2015-09-22 00:11:16
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xy531483760

金虫 (小有名气)

orf。。。我们老师让我做的就是找序列,八十多个的很正常

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比较笨的小虫虫
4楼2015-09-22 00:13:46
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xy531483760

金虫 (小有名气)

不是M的原因会不会是蛋白质不完整?我并不是特别懂,但是我实验做的步骤应该和你差不多

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比较笨的小虫虫
5楼2015-09-22 00:15:35
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