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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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ccc13

[交流] 【求助】溶剂化找过渡态时l301出错

溶剂化效应计算时 多次出现类似的情况,请前辈们帮忙看看是什么毛病。谢谢!

输入命令(溶剂化效应下找过渡态):
%chk=402ts.chk
%rwf=x1,200MW,x2,200MW,x3,200MW,x4,200MW,x5,200MW,x6,200MW,x7,-1
%mem=500mb
%nproc=1
# Opt(QST3,Noeigen,maxcycle=1000) B3LYP/6-31+g(d,p) pop=nbo freq scrf=(IEFPCM,read,solvent=water)
……(下面是产物、反映物、过渡态的分子信息)(用过这组命令曾经计算出过过渡态)

输出文件最后部分:
United Atom Topological Model (UA0  parameters set).
UA0: Hydrogen   13 is unbound. Keep it explicit at all point on the
UA0: potential energy surface to get meaningful results.
Error termination via Lnk1e in e:\g03\l301.exe at Wed Jan 01 12:43:01 2003.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes 10.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   1338 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
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ccc13

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
我比较了一下用同一行命令,那个曾经算出来的和这些算不出来的区别是:算不出来的共同点是在溶剂化效应下找过渡态都有质子氢的转移,出来结果的没有质子氢转移。而且out文件中也说“UA0: Hydrogen   13 is unbound. Keep it explicit at all point on the
UA0: potential energy surface to get meaningful results.”其中H13就是转移的质子。
请问能不能给指导一下,该怎样修改才能往下算。心切啊。谢谢啦!!!
2楼2008-09-02 09:04:49
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zhangji3013

金虫 (小有名气)


灯塔守望者(金币+1):谢谢您的解答
如果有质子迁移,溶剂化是算不出来的
3楼2008-10-16 15:30:29
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wxjbuilder

木虫 (知名作家)


灯塔守望者(金币+1):谢谢您的解答
把原子半径设成UFF的原子半径试试
RADII=UFF
悠悠天地,奈何独立苍茫?
4楼2008-10-17 21:33:36
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ccc13

引用回帖:
Originally posted by zhangji3013 at 2008-10-16 15:30:
如果有质子迁移,溶剂化是算不出来的

请问我用b3lyp,如果用了RADII=uahf 是不是不合理啊?我好多东西现在都已经用这个处理了,可以吗?
还有就是放溶剂中优化过程,有几个老是l9999出错。我试过加大循环的步数(opt(maxcycle=200)),不行;也曾经换用其他方法和小基组先算,然后在换大机组,也不行;发现能量在振荡变化还不小,检查一下初始构型没什么问题,也多次尝试手工调整过,再从头优化,但都失败了。
   其中:
Maximum Force    ………………        no
RMS     Force            ………………  no
Maximum Displacement   …………   yes
RMS     Displacement        ………… yes
最好的情况后两个或一个出YES,而前两个每次都是NO

急切盼望着您的解答~
5楼2008-11-10 10:48:03
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张文艳

交流


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
l301出错的话,你试着改一下电荷数和多重度,有可能使这里出错了
6楼2008-11-10 16:55:43
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wonderflyer

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
zzgyb(金币+3,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
我算溶剂化效应,一般会选UAHF半径。因为这个选项适合范围更广。它只是用HF方法评估溶质半径的一种方法,只要都在一种方法下计算有可比性就行。
在溶剂中优化构型,一般收敛不容易。有的构型即使你使用了各种措施也不一定收敛。所以有时评估溶剂化效应就不得不在气相优化的构型基础上进行,许多文献也是这么做的。
7楼2008-11-10 17:02:39
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ccc13

引用回帖:
Originally posted by wonderflyer at 2008-11-10 17:02:
我算溶剂化效应,一般会选。因为这个选项适合范围更广。它只是用HF方法评估溶质半径的一种方法,只要都在一种方法下计算有可比性就行。
在溶剂中优化构型,一般收敛不容易。有的构型即使你使用了各种措施 ...

说的很实用!非常感谢!
还有需要请教的:我是在算一系列不是很大的东西,现在大部分东西都用UAHF半径算了,包括反应复合物、产物、过渡态、、、只要少数出不来,愁死了,那如果只是这几种使用溶剂化下的uao半径或者干脆用气相的构型在uahf下算单点能,那结论应该就不可靠了吧? 我曾比较过uao、uahf和气相中的能量,差别很大呢。我该咋弄啊
8楼2008-11-11 09:15:28
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wonderflyer

木虫 (正式写手)

结果会差别很大,所以你所有的计算方法包括所选用的参数必须一致,否则没有可比性。
9楼2008-11-17 08:23:00
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recoli

金虫 (正式写手)

PCM的UAO模型中氢原子是依附在重原子上的,如果过渡态中发生氢原子转移,PCM就会报错。

解决办法就是换一种RADII选项,具体选项看高斯手册。
10楼2008-11-17 14:07:07
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