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纯度不太好的未知蛋白测序是做N端测序好还是二级质谱好已有6人参与
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我从蘑菇里面提取蛋白，经过初步分离后，SDS-PAGE显示出比较富集的蛋白条带，但是暂时没办法再进一步纯化，由于时间关系想先测个序，但是不知道N端测序和LS-MS-MS测序那个比较好。 我现在不清楚蛋白的纯度，分子量。想做N端测序吧，又怕那个SDS-PAGE条带只是蛋白异质多聚体中的一个亚基，这样的话测N端只是测了一个部分的亚基，意义不大，还得再做，但是做LS-MS-MS吧，我又不太了解，听说这个可以把SDS-PAGE上相同位置上的不同蛋白的序列测出来，但在网上看见这句话“我今天咨询了一下，因为是未知蛋白，工程师的意思好像N端测序是测定，质谱一般用来做鉴定，所以N端测序优先，如果实在测不出来再用质谱。”这个让我很纠结，这句话里面的质谱是指一级质谱吗？怎么和我咨询的不一样呢？ 求各位虫友指导！我到底是做N端测序好还是二级质谱好？ |
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