| 查看: 1987 | 回复: 6 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
吉米爱多铁杆木虫 (著名写手)
|
[求助]
超算中心并行版Gromacs的安装 已有3人参与
|
|
|
哪位能提供跨节点并行版本Gromacs的安装过程？我在深圳超算中心的电脑上安装了gmx，我在安装时，cmake选择了-DGMX_MPI=ON，提交作业的lsf脚本文件也用了mpirun指令。 超算是每个节点12核，用32核算时比12核速度提高了许多（32核速度是12核的2.4倍），但继续扩到64核时，比32核速度却几乎没有提升(速度是32核的1.1-1.2倍)。请问这个问题可能出在哪里？就算32核扩到64核有传输损失，也不至于那么大呀。因为相比12核到32核，32核到64核速度提升太小了。 |
回复此楼» 猜你喜欢
面上合作单位盖章
已经有5人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有8人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有7人回复
-
青基如何破局
已经有7人回复
-
基金不中，共勉
已经有10人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有11人回复
-
基金未中，这种答复是模板吗？
已经有6人回复
-
看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉……
已经有6人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 2012年中国科学院超级计算中心分子模拟软件讲习班通知（第二轮）
已经有0人回复
声梦奇缘001
木虫 (正式写手)
- 应助: 56 (初中生)
- 金币: 5597.4
- 红花: 5
- 帖子: 614
- 在线: 218.7小时
- 虫号: 2406187
- 注册: 2013-04-07
- 专业: 化学工程及工业化学
3楼2015-09-19 17:18:52
xiaowu759
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 50 (小学生)
- 金币: 15899.2
- 散金: 1597
- 红花: 15
- 帖子: 1611
- 在线: 1535.8小时
- 虫号: 98977
- 注册: 2005-11-11
- 性别: GG
- 专业: 高分子物理与高分子物理化
2楼2015-09-19 16:52:43
吉米爱多
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 6158.1
- 散金: 457
- 红花: 12
- 帖子: 1684
- 在线: 345.6小时
- 虫号: 2318682
- 注册: 2013-03-04
- 专业: 能源化工
4楼2015-09-20 10:09:45
xiaowu759
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 50 (小学生)
- 金币: 15899.2
- 散金: 1597
- 红花: 15
- 帖子: 1611
- 在线: 1535.8小时
- 虫号: 98977
- 注册: 2005-11-11
- 性别: GG
- 专业: 高分子物理与高分子物理化
5楼2015-09-20 14:22:31
10