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qichong木虫 (小有名气)
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相对定量qPCR中关于no RT control的问题
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我们的目标基因序列是染色体上一段转录活性较高的区域,长度大约有100bp,针对序列两端设计了引物扩增,以核糖体蛋白L37作为内参基因。 问题是:逆转录后样品的靶基因序列CT值是16,no RT control 样品CT值居然也达到了20?! 我开始觉得是DNA污染导致no RT control 样品CT值过高,仔细回顾发觉不太可能。 原因是1、trizol提取RNA后测得OD值为1.9,似乎没有DNA、蛋白或有机溶剂残留; 2、逆转录试剂盒自带gDNAremover去除基因组DNA反应,我们予以采用; 3、逆转录后样品的L37 CT值是18,no RT control 样品L37 CT值是37,从内参来看DNA消化完全。 其它背景:溶解曲线一致、重复性一致 恳请有经验的大神仔细解答,有可能是什么原因,非常感谢! |
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