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woxinxiang

木虫 (小有名气)

[求助] 现在做土壤微生物多样性采取454还是illumina ? 已有5人参与

因为是初次接触微生物多样性,现在做土壤微生物多样性一般采取454还是illumina ?我看454的文献好像多些
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Elainebear

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
454测序读长长,illumina测序深度深,选择哪个测序平台取决于目标条带的大小,如果超出了illumina的测序长度用454,如果两种方法都合适的话建议illumina
9楼2015-09-18 09:25:42
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查看全部 13 个回答

yanlijuan

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
illumina吧,454前两年比较流行,后来被买了之后现在走下坡了。很肤浅的回答,希望有帮助。

发自小木虫IOS客户端
2楼2015-09-16 02:56:53
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w_goodluck

铜虫 (小有名气)

妥妥的illumina,454太不好用了,而且优势不明显,如果不是真核生物或高等生物的基因组重测序 最好不要用

发自小木虫Android客户端
3楼2015-09-16 07:11:17
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20093651

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
miseq吧,测序深度比454高很多,你看看文献,有好几篇专门比较这两种测序平台的文章

发自小木虫Android客户端
但行好事,莫问前程
4楼2015-09-16 07:14:28
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