24小时热门版块排行榜    

查看: 1885  |  回复: 12

woxinxiang

木虫 (小有名气)

[求助] 现在做土壤微生物多样性采取454还是illumina ? 已有5人参与

因为是初次接触微生物多样性,现在做土壤微生物多样性一般采取454还是illumina ?我看454的文献好像多些
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

实验方法

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

20093651

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
miseq吧,测序深度比454高很多,你看看文献,有好几篇专门比较这两种测序平台的文章

发自小木虫Android客户端
但行好事,莫问前程
4楼2015-09-16 07:14:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuchi0426

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
肯定是 Miseq,  454马上停产试剂了,意味着退出舞台了,你看的文献都是以前发的,好几年了。而且Miseq深度比454高很多。
Iamthebest!
5楼2015-09-17 21:49:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanlijuan

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
illumina吧,454前两年比较流行,后来被买了之后现在走下坡了。很肤浅的回答,希望有帮助。

发自小木虫IOS客户端
2楼2015-09-16 02:56:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w_goodluck

铜虫 (小有名气)

妥妥的illumina,454太不好用了,而且优势不明显,如果不是真核生物或高等生物的基因组重测序 最好不要用

发自小木虫Android客户端
3楼2015-09-16 07:11:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

永恒的微笑

新虫 (小有名气)

看你做什么了,如果目标片段长454,如果短就用后者。

发自小木虫Android客户端
7楼2015-09-17 22:54:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

木虫 (著名写手)

无敌小木虫

本帖仅楼主可见
8楼2015-09-17 22:58:52
已阅   申请MicEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

Elainebear

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
454测序读长长,illumina测序深度深,选择哪个测序平台取决于目标条带的大小,如果超出了illumina的测序长度用454,如果两种方法都合适的话建议illumina
9楼2015-09-18 09:25:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beibeihu113

新虫 (初入文坛)

现在看到的文献,都是2、3年前做的实验。现在454已经停产了,目前都是用Illumina来做了
专注微生物生态学研究 QQ2758452825 微基生物 400-660-9270
10楼2015-12-31 15:56:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaokoupu

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

扩增子测序么illumina就好了;宏全基因组测序现在用illumina比较多(但不是说illumina在多态性分析上有绝对的优势,illumina/454/pacbio几种技术鉴定出的物种不重叠的部分也很多,比如病毒/真菌之类的,可能长片段更能有效鉴定)
12楼2016-04-17 00:34:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

hfdv_uu

木虫 (小有名气)

6楼2015-09-17 22:18:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 woxinxiang 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +52 医学老男孩 2026-08-13 115/5750 2026-08-19 12:09 by 医学老男孩
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +7 ziyangfang 2026-08-19 8/400 2026-08-19 11:40 by h初学者f
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +10 基诺咪客 2026-08-17 14/700 2026-08-19 10:34 by 基诺咪客
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +8 启萌科技 2026-08-12 30/1500 2026-08-19 10:22 by 启萌科技
[基金申请] 今天放榜吗? +11 布布和一二 2026-08-19 11/550 2026-08-19 10:06 by xter9665
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +10 yuleib84 2026-08-18 11/550 2026-08-19 07:30 by 羽毛枫f
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +3 瞬息宇宙 2026-08-15 3/150 2026-08-18 21:40 by xiaohuixin
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
信息提示
请填处理意见