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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 现在做土壤微生物多样性采取454还是illumina ？
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woxinxiang

木虫 (小有名气)

[求助] 现在做土壤微生物多样性采取454还是illumina ？ 已有5人参与

因为是初次接触微生物多样性，现在做土壤微生物多样性一般采取454还是illumina ？我看454的文献好像多些
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实验方法

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1楼 2015-09-15 20:36:45
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

20093651

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
miseq吧，测序深度比454高很多，你看看文献，有好几篇专门比较这两种测序平台的文章

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但行好事，莫问前程
4楼2015-09-16 07:14:28
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liuchi0426

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
肯定是 Miseq,  454马上停产试剂了，意味着退出舞台了，你看的文献都是以前发的，好几年了。而且Miseq深度比454高很多。
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Iamthebest!
5楼2015-09-17 21:49:52
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yanlijuan

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
illumina吧，454前两年比较流行，后来被买了之后现在走下坡了。很肤浅的回答，希望有帮助。

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2楼2015-09-16 02:56:53
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w_goodluck

铜虫 (小有名气)
妥妥的illumina，454太不好用了，而且优势不明显，如果不是真核生物或高等生物的基因组重测序 最好不要用

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3楼2015-09-16 07:11:17
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永恒的微笑

新虫 (小有名气)
看你做什么了，如果目标片段长454，如果短就用后者。

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7楼2015-09-17 22:54:08
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匿名

木虫 (著名写手)

无敌小木虫
本帖仅楼主可见
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8楼2015-09-17 22:58:52
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Elainebear

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
454测序读长长，illumina测序深度深，选择哪个测序平台取决于目标条带的大小，如果超出了illumina的测序长度用454，如果两种方法都合适的话建议illumina
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9楼2015-09-18 09:25:42
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beibeihu113

新虫 (初入文坛)
现在看到的文献，都是2、3年前做的实验。现在454已经停产了，目前都是用Illumina来做了
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专注微生物生态学研究 QQ2758452825 微基生物 400-660-9270
10楼2015-12-31 15:56:31
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xiaokoupu

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

扩增子测序么illumina就好了；宏全基因组测序现在用illumina比较多（但不是说illumina在多态性分析上有绝对的优势，illumina/454/pacbio几种技术鉴定出的物种不重叠的部分也很多，比如病毒/真菌之类的，可能长片段更能有效鉴定）
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12楼2016-04-17 00:34:46
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普通回帖

hfdv_uu

木虫 (小有名气)
三代不更好么？

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6楼2015-09-17 22:18:13
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