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XYwinne金虫 (小有名气)
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建立菱形盒子
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我建了一个菱形的盒子，命令如下 editconf -f 1.pdb -bt triclinic -box ** ** ** -c -angle 90 90 120 -o 2.pdb genbox -cp 2.pdb -ci 1.pdb -nmol 19 -o 3.pdb （加入另外19个溶质） genbox -cp3.pdb -ci 4.pdb -nmol 1000 -o 5.pdb （加入1000个溶剂） 在VMD和MS中看图形，溶质和溶剂好像还是按照立方形加入的（图形如下），之前没做过斜的盒子，不知道怎么处理？ （左边的几个分子是右边的，由于周期性出现在左边）  1.PNG |
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5楼2015-12-16 00:51:21
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