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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » discover studio 如何docking酶和底物分子？
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biology-girl

新虫 (正式写手)

[求助] discover studio 如何docking酶和底物分子？ 已有1人参与

最近准备做docking，可是不知道底物的晶体结构如何获得，酶的晶体结构用PDB网站上可以下载下来，可是酶的底物呢？
DS虽然可以自己画底物，但是底物结构比较复杂，很难画，想问一下有没有哪里可以下载到底物的晶体结构，然后用到DS中docking？
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1楼 2015-09-11 12:03:49
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biology-girl

新虫 (正式写手)
为何没有人呢？
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2楼2015-09-11 13:16:41
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biology-girl

新虫 (正式写手)
3楼2015-09-17 10:05:46
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yilanding

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

pdb就可以下载配体结构，实在不行用chemdraw画，chem3d转化为mol格式

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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很傻
4楼2015-09-20 10:31:47
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biology-girl

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yilanding at 2015-09-20 10:31:47
pdb就可以下载配体结构，实在不行用chemdraw画，chem3d转化为mol格式

从PDB可以下载配体的结构？我的底物是小分子有机化合物不是蛋白质。你下载过吗，我查了下没有找到。
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5楼2015-09-20 17:04:11
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yilanding

木虫 (著名写手)
我下过，你看一下。

发自小木虫Android客户端
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很傻
6楼2015-09-20 18:55:58
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biology-girl

新虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by yilanding at 2015-09-20 18:55:58
我下过，你看一下。

还是没找到，你可以举个例子给我演示一下吗，麻烦了。
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7楼2015-09-21 12:57:17
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yilanding

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1XBI
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很傻
8楼2015-09-22 11:14:56
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yilanding

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by biology-girl at 2015-09-21 12:57:17
还是没找到，你可以举个例子给我演示一下吗，麻烦了。...

这个不就可以下载么
discover studio 如何docking酶和底物分子？
捕获.PNG
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很傻
9楼2015-09-22 11:17:18
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