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biology-girl

新虫 (正式写手)

[求助] discover studio 如何docking酶和底物分子? 已有1人参与

最近准备做docking,可是不知道底物的晶体结构如何获得,酶的晶体结构用PDB网站上可以下载下来,可是酶的底物呢?
DS虽然可以自己画底物,但是底物结构比较复杂,很难画,想问一下有没有哪里可以下载到底物的晶体结构,然后用到DS中docking?
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biology-girl

新虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yilanding at 2015-09-20 18:55:58
我下过,你看一下。

还是没找到,你可以举个例子给我演示一下吗,麻烦了。
7楼2015-09-21 12:57:17
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yilanding

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

pdb就可以下载配体结构,实在不行用chemdraw画,chem3d转化为mol格式

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
很傻
4楼2015-09-20 10:31:47
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biology-girl

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yilanding at 2015-09-20 10:31:47
pdb就可以下载配体结构,实在不行用chemdraw画,chem3d转化为mol格式

从PDB可以下载配体的结构?我的底物是小分子有机化合物不是蛋白质。你下载过吗,我查了下没有找到。
5楼2015-09-20 17:04:11
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yilanding

木虫 (著名写手)

我下过,你看一下。

发自小木虫Android客户端
很傻
6楼2015-09-20 18:55:58
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