应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 在vasp中优化掺氮石墨烯，优化后结构很诡异，大神们帮我分析分析吧
51/1返回列表
查看: 1601  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

beidou52

新虫 (小有名气)

[交流] 在vasp中优化掺氮石墨烯，优化后结构很诡异，大神们帮我分析分析吧 已有4人参与

在medea中建的模型，图一是原始结构，图二是优化后的结构，这个优化结果也太诡异了，大神们帮我分析分析吧
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2015-09-09 19:48:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mywtfmp3

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
没有问题的。有一个原子超出了边界，被画到了另一个晶胞而已。你把所有的原子的位置平移一下，就能显示在同一个unit cell里面了。
我喜欢用vesta，里面有一个功能是transform unit cell，可以移动origin，更改unit cell大小。非常好用，你可以试一试。
赞一下 回复此楼
6楼2015-09-14 16:12:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

xrdcvw73

新虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
建议楼主调调显示
我觉得很可能是周期性显示的问题，这个应该是能够调的....
没用过medea
不过vesta和ms 中都是可以调节各种现实，2x2的显示你的结构，就看得到具体的问题了
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2015-09-09 23:09:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beidou52

新虫 (小有名气)
请问如何调整显示呢，我用cif导回material studio中就跟在medea中是一样的怪异结构，并且原子全部变成了碳原子，用xyz导回MS中则位置和原子都没有问题，但是丢失了晶体结构，不知道你碰到过这种问题没
赞一下 回复此楼
3楼2015-09-10 11:09:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luzihen

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
xrdcvw73 说的是对的,这个是周期性边界显示的问题.明显有原子跑到对面去了
构型没什么大问题
赞一下 回复此楼
4楼2015-09-13 14:07:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 关于代码变化问题，想知道的进来 +9 且听虎啸 2026-08-07 12/600 2026-08-07 21:53 by 理想三旬2025
[基金申请] 基金中了 +13 laoda193707 2026-08-06 13/650 2026-08-07 20:33 by tchen18
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[论文投稿] 十年后又回来了，论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +4 yang182083 2026-08-06 6/300 2026-08-07 12:43 by 虫友是什么虫
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的，举个手。玩一下，释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息？这个有何含义？？？ +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 有没有H口的？有收到消息的吗？ +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐，不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息，有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 什么时候能放榜呀？ +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭