24小时热门版块排行榜    

查看: 2425  |  回复: 6

apple_Y

木虫 (初入文坛)

[求助] 简并引物的设计怎么选择保守序列? 已有1人参与

想扩增某昆虫的未知基因片段,能搜索到的最近亲缘关系3个物种蛋白序列相似度不足30%,请问这样的保守序列能设计简并引物么?谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiqinger

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
apple_Y: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-09 09:44:41
可以在搜一下,实在不行的话可以找一下相对比较保守的区域设计引物。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

123456
2楼2015-09-08 19:00:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

apple_Y

木虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiqinger at 2015-09-08 19:00:25
可以在搜一下,实在不行的话可以找一下相对比较保守的区域设计引物。

请问能用亲缘关系远的物种蛋白序列么?比如哺乳动物的。

发自小木虫Android客户端
3楼2015-09-09 09:44:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

apple_Y

木虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiqinger at 2015-09-08 19:00:25
可以在搜一下,实在不行的话可以找一下相对比较保守的区域设计引物。

请问象这样C和D两个保守序列是不是离得太近了?
简并引物的设计怎么选择保守序列?
捕获.PNG

4楼2015-09-09 10:55:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiqinger

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
apple_Y: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-09 15:23:35
引用回帖:
3楼: Originally posted by apple_Y at 2015-09-09 09:44:09
请问能用亲缘关系远的物种蛋白序列么?比如哺乳动物的。
...

可以,但是最好是用昆虫的序列。
123456
5楼2015-09-09 14:27:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiqinger

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by apple_Y at 2015-09-09 10:55:47
请问象这样C和D两个保守序列是不是离得太近了?

捕获.PNG
...

应该还可以,但是设计引物时要考虑密码子偏好性。
123456
6楼2015-09-09 14:29:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飒飒儿

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by apple_Y at 2015-09-09 10:55:47
请问象这样C和D两个保守序列是不是离得太近了?

捕获.PNG
...

咨询一下大神,这个是用什么操作的啊?

发自小木虫Android客户端
7楼2023-03-24 09:55:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 apple_Y 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿武理材料工程348求调剂 +4  ̄^ ̄゜汗 2026-03-19 6/300 2026-03-22 17:44 by luoyongfeng
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 考研调剂 +4 来好运来来来 2026-03-21 4/200 2026-03-22 12:15 by 星空星月
[考研] 生物学一志愿985,分数349求调剂 +4 zxts12 2026-03-21 7/350 2026-03-22 09:57 by zxts12
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 材料与化工(0856)304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-20 7/350 2026-03-21 19:05 by 15709483992
[考研] 一志愿深大,0703化学,总分302,求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[基金申请] 学校已经提交到NSFC,还能修改吗? 40+4 babangida 2026-03-19 9/450 2026-03-21 16:12 by babangida
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +14 chaojifeixia 2026-03-19 15/750 2026-03-21 13:24 by zhukairuo
[考研] 材料 336 求调剂 +3 An@. 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:39 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 阿姐阿姐家啊 2026-03-18 3/150 2026-03-20 23:24 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 司空. 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:08 by JourneyLucky
[考研] 求调剂,一志愿:南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕,总分289分 +4 @taotao 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:14 by JourneyLucky
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
[考研] 081700化工学硕调剂 +3 【1】 2026-03-16 3/150 2026-03-19 23:40 by edmund7
[考研] 材料,纺织,生物(0856、0710),化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
信息提示
请填处理意见