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apple_Y

木虫 (初入文坛)

[求助] 简并引物的设计怎么选择保守序列? 已有1人参与

想扩增某昆虫的未知基因片段,能搜索到的最近亲缘关系3个物种蛋白序列相似度不足30%,请问这样的保守序列能设计简并引物么?谢谢!
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apple_Y

木虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiqinger at 2015-09-08 19:00:25
可以在搜一下,实在不行的话可以找一下相对比较保守的区域设计引物。

请问象这样C和D两个保守序列是不是离得太近了?
简并引物的设计怎么选择保守序列?
捕获.PNG

4楼2015-09-09 10:55:47
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jiqinger

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
apple_Y: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-09 09:44:41
可以在搜一下,实在不行的话可以找一下相对比较保守的区域设计引物。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

123456
2楼2015-09-08 19:00:25
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apple_Y

木虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiqinger at 2015-09-08 19:00:25
可以在搜一下,实在不行的话可以找一下相对比较保守的区域设计引物。

请问能用亲缘关系远的物种蛋白序列么?比如哺乳动物的。

发自小木虫Android客户端
3楼2015-09-09 09:44:09
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jiqinger

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
apple_Y: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-09 15:23:35
引用回帖:
3楼: Originally posted by apple_Y at 2015-09-09 09:44:09
请问能用亲缘关系远的物种蛋白序列么?比如哺乳动物的。
...

可以,但是最好是用昆虫的序列。
123456
5楼2015-09-09 14:27:36
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