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嘻嘻小巫

金虫 (小有名气)

[求助] 急!PCR产物做模板,改变primer做第二次PCR,无条带! 已有1人参与

求助:
想通过三次PCR,延长序列,目标size:5kb
第一次PCR,5kb处为主带,下方small size有杂带,为避免下次PCR干扰,切胶回收产物,纯化后跑胶,再无杂带,条带清洗明亮。
用该产物做第二次PCR,希望在5‘端加入50bp,故此次PCR的5’primer为70bp,其中有28bp与第一次PCR primer重合,3‘ primer与第一次完全相同25bp,做第二次PCR,怎么做,都没有结果,只有非常小的区域有杂带。尝试更换新的酶(Phusion)和buffer,尝试不同的program都无效,98°热启动,98°:30’’,61°:30’’,72°:2’30’’,优化过不同的退火温度,也用过4’的延长时间,都是一点产物都没有。查了很多资料,看了很多帖子,不知道问题究竟出在哪里。
请教各位,问题出在哪里,有做过类似的实验请给点建议。
谢谢!
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