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启从QICONG

新虫 (初入文坛)

[求助] 为什么用提藻的DNA做18sRNA的PCR就是做不出来 已有1人参与

我提了三角褐指藻的总DNA,跑电泳,跑出来了,而且比marker还亮,但是我把总DNA稀释2、4、6、8倍做18sPCR,跑不出条带,后来查了一下资料,说做PCR的模板有1ng的DNA就够了。所以后来我又跑胶,估计了一下DNA的浓度,浓度应该是大于100ng/5ul的,就把提出来的DNA稀释了50倍、100倍、150倍、200倍再做18sRNA的PCR,但是后来跑胶还是没有跑出来,我想问问各位大神,这到底是怎么了?哪里出问题了?我接下来该怎么办?
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

引用回帖:
3楼: Originally posted by 启从QICONG at 2015-09-03 13:12:45
我后来用高保真酶p出来了,但条带不是很清晰,请问怎样改进才能让条带更亮一些...

优化实验条件
选择条带已经出来了,这是好事
退火温度,升高退火温度可以提高特异性,现在你这是条带不清楚,可以试试降低退火温度看,胶浓度也很重要,但往往会被忽视~
对模板引物浓度酶量也要摸索,说明书可以参考,如果结果不满意,还是要摸索优化条件的,毕竟模板不唯一嘛,另外实验做对照组,可以排除很多原因,还有参考marker
,没有图不好具体判断
todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
4楼2015-09-06 09:50:51
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
启从QICONG: 金币+4, ★★★很有帮助, 太赞啦,谢谢啦 2015-09-02 11:53:47
不一定是1ng,看你是什么模板,不同来源的模板和上样量的要求,看资料里边有(http://www.detaibio.com/topics/pcr-faq-specific-amplify.html)
模板浓度,引物浓度,酶浓度这些东西按照酶的说明书操作都能扩增出来,跑不出来,稍微优化一下体系也差不多能有个结果,你不要只纠结于模板浓度,毕竟是分子实验多方面考虑啊,引物特异性验证,扩增酶要高特异性热启动聚合酶扩增,摸索温度条件等,祝成功
todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
2楼2015-09-01 10:16:05
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启从QICONG

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 18761615793 at 2015-09-01 10:16:05
不一定是1ng,看你是什么模板,不同来源的模板和上样量的要求,看资料里边有(http://www.detaibio.com/topics/pcr-faq-specific-amplify.html)
模板浓度,引物浓度,酶浓度这些东西按照酶的说明书操作都能扩增出 ...

我后来用高保真酶p出来了,但条带不是很清晰,请问怎样改进才能让条带更亮一些
3楼2015-09-03 13:12:45
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