应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » EMSA/ChIP » 怎样知道基因的启动子序列
51/1返回列表
查看: 3236  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhangy1027

新虫 (正式写手)

[求助] 怎样知道基因的启动子序列 已有2人参与

我想做一个基因调控human IL17A 的基因转录，在NCBI 上搜索，网页如下：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... amp;amp;to=52190638，其mRNA            join(1..72,1217..1419,2669..4252)，从第一位就是外显子区了，那它的启动子区在哪？
请教各位大神，这个怎么查它的启动子？
谢谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

收藏夹 小宇宙无极限

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-08-30 13:51:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

976592787

木虫 (正式写手)

国家自然科学基金委员会委员长

【答案】应助回帖

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-08-30 23:05:55
我还是把结果copy给你吧，望采纳！这是原网页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... amp;amp;to=52190638
CCCCCCGAGTTAGCATGTAGAATATGGGATACCAGCTGAGTGCCTGAGAGTTATCATTCACCTCAGTGGGGGTAGGGGCGGAGAAGGGTGACATATAGCCAGCCACATCTATATCCACTGGCCCTTCCTTGTCCTAGTCCTCTGTATTCCTGAGAAGGAACTATTCTCAAGGACCTGAGTCCAAGTTCATCTTACTTAGAGTACAGAGAAAAGAACCGCTAACTCCTTCTCTCTTTCCCCCATCATGTCTCCTCTCCTTTCTAGTTCTCATCACTCTCTACTCCCCCCTGCCCCCCTTTTCTCCATCTCCATCACCTTTGTCCAGTCTCTATCCCCATTTTCAATTCCTTCCTCAAAACACCAAGTTGCTTGGTAGCATGCAGGGTTGGAACATGCCTTTAACAGAAAATCTCGTGTCTCTTGAACCTAGTTATTTATTCCTTGAGCAGAGTAGATATTCAACAAAAGAATTGTTAAATTCAATTAAATAGGATATATCTTATTATTAAATATTTTTTTCATTTTTTGTTTACTTATATGATGGGAACTTGAGTAGTTTCCGGAATTGTCTCCACAACACCTGGCCAAGGAATCTGTGAGGAAAAGAAAGATCAAATGGAAAATCAAGGTACATGACACCAGAAGACCTACATGTTACTTCAAACTTTTTCTTCCTCATGAACCATTAAAATAGAGCATAACTCTTCTGGCAGCTGTACATATGTTCATAAATACATGATATTGACCCATAGCATAGCAGCTCTGCTCAGCTTCTAACAAGTAAGAATGAAAAGAGGACATGGTCTTTAGGAACATGAATTTCTGCCCTTCCCATTTTCCTTCAGAAGGAGAGATTCTTCTATGACCTCATTGGGGGCGGAAATTTTAACCAAAATGGTGTCACCCCTGAACCCACTGCGACACGCCACGTAAGTGACCACAGAAGGAGAAAAGCCCTATAAAAAGAGAGACGATAGCGCTACATTTTGTCCATCTCATAG
赞一下 回复此楼
耻与众草之为伍，何亭亭而独芳！何不为人之所赏兮，深山穷谷委严霜。
3楼2015-08-30 15:28:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

976592787

木虫 (正式写手)

国家自然科学基金委员会委员长

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+4, 鼓励回帖交流 2015-08-30 23:05:42
zhangy1027: 金币+40, ★★★★★最佳答案, 终于搞明白了 2015-08-31 08:11:14
启动子一般是指全基因序列上游1000bp的序列，操作如下：选择Gene，输入基因名称——选择人源Human的基因——点击页面上Genomic regions右侧的FASTA文本——得到一段完整的基因序列，右侧有可选区域fromXXXXXtoYYYYY再把其改为fromXXXXX-1000toXXXXX
注意：基因上游有时候会在YYYYY+1000处，因为该基因与NCBI序号编码的方向相反，基因页面有个深颜色的红箭头，要注意观察哦

这是我研究几个月，使用近半年的经验，希望采纳，谢谢！

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
耻与众草之为伍，何亭亭而独芳！何不为人之所赏兮，深山穷谷委严霜。
2楼2015-08-30 15:22:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-08-30 23:06:09
zhangy1027: 金币+10, ★★★很有帮助, 明白了，谢谢 2015-08-31 08:11:36
一般基因启动子位于该基因编码区上游2000bp内，在你打开的界面右上角有个选择范围的输入框，在里面输入基因上游2000bp范围即可，即从52186185到52186385,。
赞一下 回复此楼
4楼2015-08-30 16:09:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangy1027

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 976592787 at 2015-08-30 15:28:51
我还是把结果copy给你吧，望采纳！这是原网页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_000006.12?report=fasta&from=52186387&to=52190638
CCCCCCGAGTTAGCATGTAGAATATGGGATACCAGCTGAGTGCCTGAGAGTTATCATTCA ...

前辈，不胜感激，你知道怎么寻找它的核心启动子区吗？
赞一下 回复此楼
5楼2015-08-30 17:13:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 广东省 085601 329分求调剂 +8 Eddieddd 2026-04-10 8/400 2026-04-10 20:40 by xihu1109
[考研] 一志愿京区985，085401，与本科专业一致，电子信息工程， +4 阳光开朗的男孩 2026-04-10 4/200 2026-04-10 18:27 by shenrf
[考研] 求调剂 +11 雪逢冬 2026-04-10 11/550 2026-04-10 14:38 by Abskk
[考研] 288求调剂 +12 代fish 2026-04-09 12/600 2026-04-10 11:57 by jxlabyan
[考研] 求调剂 +9 翩翩一书生 2026-04-09 9/450 2026-04-10 11:43 by wp06
[考研] 0702物理学学硕299求调剂 +6 祁柒连 2026-04-06 6/300 2026-04-10 11:10 by Roomoo
[考研] 材料专硕调剂 +16 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-07 17/850 2026-04-09 21:16 by wutongshun
[考研] 070300化学 求调剂 +13 73372112 2026-04-08 13/650 2026-04-09 20:22 by maddjdld
[考研] 267求调剂 +5 再忙也要吃饭啊 2026-04-09 5/250 2026-04-09 18:47 by stone_128
[考研] 312求调剂 +3 李鸿飞飞 2026-04-06 3/150 2026-04-09 17:32 by wp06
[考研] 286求调剂 +19 Faune 2026-04-08 20/1000 2026-04-09 08:36 by 哦哦123
[考博] 申博 +8 IQwQl 2026-04-04 8/400 2026-04-08 09:43 by 0608104024
[考研] 323求调剂 +3 林zlu 2026-04-07 4/200 2026-04-07 23:21 by lbsjt
[考研] 机械调剂 +3 zzzbcb 2026-04-07 3/150 2026-04-07 22:19 by hemengdong
[考研] 081700，311，求调剂 +17 冬十三 2026-04-04 18/900 2026-04-07 12:50 by Sammy2
[考研] 071000生物学调剂 +7 拉提桃 2026-04-06 7/350 2026-04-06 18:55 by 52305043001
[考研] 358求调剂 +7 秋gk 2026-04-04 7/350 2026-04-05 13:29 by huangmoli
[考研] 工科277分求调剂材料 +8 上了上了上哦 2026-04-05 9/450 2026-04-05 13:05 by wwytracy
[考研] 一志愿东北大学085901土木专硕345求调剂 +3 zxt11111 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:21 by 土木硕士招生
[考研] 怎么删帖子啊 +3 缝曦1000 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:20 by 土木硕士招生
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭