| 查看: 3187 | 回复: 13 | ||||
zhangy1027新虫 (正式写手)
|
[求助]
怎样知道基因的启动子序列 已有2人参与
|
|
我想做一个基因调控human IL17A 的基因转录，在NCBI 上搜索，网页如下：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... amp;amp;to=52190638，其mRNA join(1..72,1217..1419,2669..4252)，从第一位就是外显子区了，那它的启动子区在哪？ 请教各位大神，这个怎么查它的启动子？ 谢谢！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 收藏夹 | 小宇宙无极限 |
» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有234人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎样获得基因全长，
已经有6人回复
- 求助生物信息学启动子区转录因子结合位点的预测
已经有1人回复
- 怎样用启动子+GFP 验证印记基因
已经有1人回复
- 有关西红柿转基因成分的检测方法
已经有0人回复
- 谈谈我对转基因的看法吧
已经有95人回复
- 美国中小学不及中国 为何大学那么牛？
已经有2人回复
- tair网站拟南芥promoter下载
已经有0人回复
- 酵母转化验证方法
已经有15人回复
- 在NCBI中查到一个基因怎么看操纵子和启动子区域？
已经有20人回复
- 原核表达问题
已经有1人回复
- 【专题】PCR实验技术指南
已经有535人回复
- 怎样克隆抗性基因及其启动子
已经有8人回复
976592787
木虫 (正式写手)
国家自然科学基金委员会委员长
- 应助: 29 (小学生)
- 金币: 2365.1
- 散金: 999
- 红花: 10
- 帖子: 870
- 在线: 179.8小时
- 虫号: 2823824
- 注册: 2013-11-24
- 性别: GG
- 专业: 抗肿瘤药物药理
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+4, 鼓励回帖交流 2015-08-30 23:05:42
zhangy1027: 金币+40, ★★★★★最佳答案, 终于搞明白了 2015-08-31 08:11:14
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+4, 鼓励回帖交流 2015-08-30 23:05:42
zhangy1027: 金币+40, ★★★★★最佳答案, 终于搞明白了 2015-08-31 08:11:14
|
启动子一般是指全基因序列上游1000bp的序列，操作如下：选择Gene，输入基因名称——选择人源Human的基因——点击页面上Genomic regions右侧的FASTA文本——得到一段完整的基因序列，右侧有可选区域fromXXXXXtoYYYYY再把其改为fromXXXXX-1000toXXXXX 注意：基因上游有时候会在YYYYY+1000处，因为该基因与NCBI序号编码的方向相反，基因页面有个深颜色的红箭头，要注意观察哦 这是我研究几个月，使用近半年的经验，希望采纳，谢谢！ 发自小木虫Android客户端 |
2楼2015-08-30 15:22:24
976592787
木虫 (正式写手)
国家自然科学基金委员会委员长
- 应助: 29 (小学生)
- 金币: 2365.1
- 散金: 999
- 红花: 10
- 帖子: 870
- 在线: 179.8小时
- 虫号: 2823824
- 注册: 2013-11-24
- 性别: GG
- 专业: 抗肿瘤药物药理
【答案】应助回帖
★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-08-30 23:05:55
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-08-30 23:05:55
|
我还是把结果copy给你吧，望采纳！这是原网页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... amp;amp;to=52190638 CCCCCCGAGTTAGCATGTAGAATATGGGATACCAGCTGAGTGCCTGAGAGTTATCATTCACCTCAGTGGGGGTAGGGGCGGAGAAGGGTGACATATAGCCAGCCACATCTATATCCACTGGCCCTTCCTTGTCCTAGTCCTCTGTATTCCTGAGAAGGAACTATTCTCAAGGACCTGAGTCCAAGTTCATCTTACTTAGAGTACAGAGAAAAGAACCGCTAACTCCTTCTCTCTTTCCCCCATCATGTCTCCTCTCCTTTCTAGTTCTCATCACTCTCTACTCCCCCCTGCCCCCCTTTTCTCCATCTCCATCACCTTTGTCCAGTCTCTATCCCCATTTTCAATTCCTTCCTCAAAACACCAAGTTGCTTGGTAGCATGCAGGGTTGGAACATGCCTTTAACAGAAAATCTCGTGTCTCTTGAACCTAGTTATTTATTCCTTGAGCAGAGTAGATATTCAACAAAAGAATTGTTAAATTCAATTAAATAGGATATATCTTATTATTAAATATTTTTTTCATTTTTTGTTTACTTATATGATGGGAACTTGAGTAGTTTCCGGAATTGTCTCCACAACACCTGGCCAAGGAATCTGTGAGGAAAAGAAAGATCAAATGGAAAATCAAGGTACATGACACCAGAAGACCTACATGTTACTTCAAACTTTTTCTTCCTCATGAACCATTAAAATAGAGCATAACTCTTCTGGCAGCTGTACATATGTTCATAAATACATGATATTGACCCATAGCATAGCAGCTCTGCTCAGCTTCTAACAAGTAAGAATGAAAAGAGGACATGGTCTTTAGGAACATGAATTTCTGCCCTTCCCATTTTCCTTCAGAAGGAGAGATTCTTCTATGACCTCATTGGGGGCGGAAATTTTAACCAAAATGGTGTCACCCCTGAACCCACTGCGACACGCCACGTAAGTGACCACAGAAGGAGAAAAGCCCTATAAAAAGAGAGACGATAGCGCTACATTTTGTCCATCTCATAG |
3楼2015-08-30 15:28:51
4楼2015-08-30 16:09:35
zhangy1027
新虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1054.7
- 散金: 80
- 红花: 1
- 帖子: 790
- 在线: 68.1小时
- 虫号: 2842633
- 注册: 2013-12-02
- 专业: 神经生物学
5楼2015-08-30 17:13:35
976592787
木虫 (正式写手)
国家自然科学基金委员会委员长
- 应助: 29 (小学生)
- 金币: 2365.1
- 散金: 999
- 红花: 10
- 帖子: 870
- 在线: 179.8小时
- 虫号: 2823824
- 注册: 2013-11-24
- 性别: GG
- 专业: 抗肿瘤药物药理
【答案】应助回帖
|
其实没有必要再找核心启动子，因为启动子区的转录起始部位，TATA框，CAAT框和增强子等之间都有或多或少的碱基差距，而且有时相距会很远，1000bp里一般已经包括了该基因启动子区，通常用于转录因子活性分析的实验，因为太短或太长的话构建到载体时候会产生这样那样的问题，如太短回收难度大，太长可能酶切位点不好选。 发自小木虫Android客户端 |
6楼2015-08-30 17:42:43
zhangy1027
新虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1054.7
- 散金: 80
- 红花: 1
- 帖子: 790
- 在线: 68.1小时
- 虫号: 2842633
- 注册: 2013-12-02
- 专业: 神经生物学
7楼2015-08-30 17:43:58
976592787
木虫 (正式写手)
国家自然科学基金委员会委员长
- 应助: 29 (小学生)
- 金币: 2365.1
- 散金: 999
- 红花: 10
- 帖子: 870
- 在线: 179.8小时
- 虫号: 2823824
- 注册: 2013-11-24
- 性别: GG
- 专业: 抗肿瘤药物药理
8楼2015-08-30 17:46:18
976592787
木虫 (正式写手)
国家自然科学基金委员会委员长
- 应助: 29 (小学生)
- 金币: 2365.1
- 散金: 999
- 红花: 10
- 帖子: 870
- 在线: 179.8小时
- 虫号: 2823824
- 注册: 2013-11-24
- 性别: GG
- 专业: 抗肿瘤药物药理
9楼2015-08-30 17:50:15
976592787
木虫 (正式写手)
国家自然科学基金委员会委员长
- 应助: 29 (小学生)
- 金币: 2365.1
- 散金: 999
- 红花: 10
- 帖子: 870
- 在线: 179.8小时
- 虫号: 2823824
- 注册: 2013-11-24
- 性别: GG
- 专业: 抗肿瘤药物药理
10楼2015-08-30 17:55:01
