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Tama二等兵

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于同源重组 已有5人参与

谁能告诉我同源重组的反应温度为什么是50度,各种酶是怎么作用的,或者哪本参考书可以给我解答
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jindiao

铁虫 (初入文坛)

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引用回帖:
8楼: Originally posted by Tama二等兵 at 2015-09-04 20:53:47
您的意思是通过聚合酶的外切,使两段具有OVERLAP的DNA互补配对连接是吗?overlap一定要在两段DNA片段的首尾么?我们酶切载体时偶尔会取与目标酶切位点靠近的酶切位点(一般十几个bp),这样的话对重组影响大么?...

是同源重组机理,但是是三个酶,不是一个酶,与好多同源重组试剂盒不一样的是,Gibson assembly可以在体外形成闭合环状DNA,这点和传统的连接比较像。
稍微具体的原理是:
核酸外切酶(最适温度在37°左右)从各DNA片段5‘端开始水解(在50°也可以发挥作用,但是很快就会失去活力),由于它是单链水解酶,所以会暴露出一部分3’端的单链,这样同源的各DNA片段可以退火形成互补,这时DNA聚合酶开始作用(缓冲液内有dNTP,镁离子),把剩余的GAP补齐。然后高温连接酶(缓冲液内还需要NAD)将补齐的末端连接,形成共价闭合状态。
http://www.nature.com/nmeth/jour ... .html#opennewwindow
上述文章有着非常清晰的描述,你可以仔细看一下。
如果你的overlap不在首尾,有十几个pb的非同源区,我猜测应该也是可以的,但是效率会降低。
9楼2015-09-10 09:27:03
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迷迭的微笑

新虫 (初入文坛)

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有这种说法吗?你在哪看到的啊?你做的哪方面啊?
2楼2015-08-29 20:15:23
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仇峰12306

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
应该不是确定的50℃吧,我也不确定
3楼2015-08-29 21:12:21
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jindiao

铁虫 (初入文坛)

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Tama二等兵: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-08-31 20:52:40
楼主说的是体外同源重组Gibson assembly实验条件吧?
简单来讲,这是位于Venter Institute的Gibson博士开发的一种体外同源重组技术,用于合成和获得大片段DNA的方法。具体原理请参见http://www.nature.com/nmeth/journal/v6/n5/full/nmeth.1318.html
文献名:Enzymatic assembly of DNA molecules up to several hundred kilobases
4楼2015-08-30 08:23:22
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