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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 配体分子的拓扑文件的制作
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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yylcx

金虫 (正式写手)

[求助] 配体分子的拓扑文件的制作 已有1人参与

各位虫友好，我想知道大家怎么样得到一些配体小分子的拓扑文件，比如说多巴胺分子之类的药物小分子。我用的CHARMM力场，NAMD。之前有在文献里看到说一些配体小分子的拓扑文件来源于VEGAZZ，这个软件 之前没有接触过，有会用的指导一下吗？
跪求大家帮助啊
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1楼 2015-08-28 21:37:37
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zhouling1019

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yylcx at 2015-08-29 14:06:14
恩恩，真心头大~~~...

你是做分子模拟的吗？我正要找一个小分子金诺芬的拓扑文件和参数文件，我想问问你是通过哪些途径找小分子的这些参数的？谢谢您！
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15楼2016-03-03 21:00:41
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yylcx

金虫 (正式写手)
木有人过来帮忙嘛
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2楼2015-08-29 13:51:18
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fantasy19841003

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我最近也在做，一样不太明白

发自小木虫Android客户端
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3楼2015-08-29 14:05:32
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yylcx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by fantasy19841003 at 2015-08-29 14:05:32
我最近也在做，一样不太明白

恩恩，真心头大~~~
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4楼2015-08-29 14:06:14
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