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303103263

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分子动力学模拟

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lsloneil

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引用回帖:
8楼: Originally posted by 303103263 at 2015-08-26 15:13:02
请问MS里怎么对一段时间内的结构性质求平均? 我运行完GULP分子动力学后又两个文件,一个是xsd,这个存储的是最终的构型,一个是xtd,这个存储的是模拟过程中构型的变化,forcite里的analysi可以对xtd进行分析并求 ...

我没用过MS……
9楼2015-08-27 12:07:58
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15216105346

金虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
个人看法!
结构优化是找局部能量最低,而分子动力学是全局最低能量!

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-08-27 07:48:07
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
303103263: 金币+3, 很棒 2015-08-27 09:31:16
结构优化是找到能量最低点。

分子动力学是为了计算统计力学里的系综平均。也就是说,在一个给定系综里(比如NVT),不同能量的构型是按照一定概率分布的(玻尔兹曼分布),分子动力学是要对所有这些可能的构型求平均(而不仅局限于能量最低的构型)。如果不明白这一点,去找本统计力学的教材,把最基本的系综理论那部分看完就差不多懂了。
3楼2015-08-27 08:57:10
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303103263

禁虫 (小有名气)

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4楼2015-08-27 09:30:53
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