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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 单晶中有多余的原子
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gyldmy

铜虫 (小有名气)

[求助] 单晶中有多余的原子 已有2人参与

RT，请问单晶出现下图怎么办？


单晶中有多余的原子
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1楼 2015-08-21 16:52:11
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
很明显，这个苯酚基团是无序的状态，而且是按照两个无序组分进行精修的，只有你检查时出现的错误，在cif文件中按照calc值改正过来就可以了；
PLAT026_ALERT_3_B Ratio Observed / Unique Reflections too Low ....         38 %     这个错误说明你的化合物衍射太弱，应该找一个大一点且质量好的单晶重新收录。
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5楼2015-08-24 12:56:28
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木瓜少爷

至尊木虫 (文坛精英)

魔导师

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个不是多余，是你单晶中存在着统计分布的情况~
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2楼2015-08-21 16:57:55
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gyldmy

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 木瓜少爷 at 2015-08-21 16:57:55
这个不是多余，是你单晶中存在着统计分布的情况~

可以把他们修掉吗？我在线检测，有好多错误，我怀疑和他们有关


PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........     Please Do !
PLAT722_ALERT_1_A Angle   Calc      123.00, Rep     119(10) Dev...       4.00 Degree
              C26' -C25' -C24     1.555   1.555   1.555      #        107      
PLAT722_ALERT_1_A Angle   Calc      115.00, Rep     121(10) Dev...       6.00 Degree
              C26' -C25' -C30'    1.555   1.555   1.555      #        108      
Alert level B
PLAT026_ALERT_3_B Ratio Observed / Unique Reflections too Low ....         38 %     
PLAT722_ALERT_1_B Angle   Calc      121.00, Rep     118(10) Dev...       3.00 Degree
              C26  -C25  -C30     1.555   1.555   1.555      #         89      
PLAT722_ALERT_1_B Angle   Calc      122.00, Rep     119(10) Dev...       3.00 Degree
              C24  -C25' -C30'    1.555   1.555   1.555      #        109      
PLAT722_ALERT_1_B Angle   Calc      117.00, Rep     120(10) Dev...       3.00 Degree
              O4'  -C26' -C25'    1.555   1.555   1.555      #        110      
PLAT722_ALERT_1_B Angle   Calc      122.00, Rep     119(10) Dev...       3.00 Degree
              C25' -C26' -C27'    1.555   1.555   1.555      #        112      
PLAT722_ALERT_1_B Angle   Calc      122.00, Rep     119(10) Dev...       3.00 Degree
              C29' -C30' -C25'    1.555   1.555   1.555      #        122
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3楼2015-08-21 17:10:29
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木瓜少爷

至尊木虫 (文坛精英)

魔导师

【答案】应助回帖

统计分布存在是很正常的现象，不是错误~你找懂得解晶体的处理下就OK了
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4楼2015-08-21 17:22:00
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