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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 动力学模拟后的蛋白结构显示问题
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anyachan

木虫 (小有名气)

[求助] 动力学模拟后的蛋白结构显示问题 已有2人参与

我用gromacs模拟后的一个小蛋白，可以算是多肽吧，二级结构用do_dssp看到有helix,b-sheet，但是在pymol，ds, chimera，vmd打开显示都没有,pymol里全是coil样的，别的还有helix，这是怎么回事? 感觉不同的软件识别二级结构好像差别很大。
xiexiexiexie！
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1楼 2015-08-21 10:40:49
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
vmd不是可以选择二级结构显示的么
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gromacs
2楼2015-08-21 16:48:20
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MHSW

禁言 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
3楼2015-09-19 19:51:27
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