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[求助]
DS分子对接初学~遇到困难,求帮助。
各位虫友,我最近刚开始学习DS,在对照教程练习分子对接时遇到一点问题。
1、我按照教程一步步进行到修改参数那一步时发现在教程里面的Ligand Partial Charge Method后面填写的是Momany-Rone,而我自己的里面则没有这个选项,只有CHARMm、MMFF、cff,如附件图中所示。
2、教程中写到这个对接过程在Pentimu 4,2Gb RAM, 2.8GHz machine 的电脑上运行需要大约30分钟左右,而在我自己的电脑上则没完没了的跑了17个小时还没结束(用的蛋白质和配体全是教程里一模一样的~)。
小虫子接触DS不过几天时间,实在摸不着头脑,求各位大牛多加指点~~
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