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yylcx

金虫 (正式写手)

[求助] DS分子对接初学~遇到困难,求帮助。

各位虫友,我最近刚开始学习DS,在对照教程练习分子对接时遇到一点问题。
1、我按照教程一步步进行到修改参数那一步时发现在教程里面的Ligand  Partial Charge Method后面填写的是Momany-Rone,而我自己的里面则没有这个选项,只有CHARMm、MMFF、cff,如附件图中所示。
2、教程中写到这个对接过程在Pentimu 4,2Gb RAM, 2.8GHz machine 的电脑上运行需要大约30分钟左右,而在我自己的电脑上则没完没了的跑了17个小时还没结束(用的蛋白质和配体全是教程里一模一样的~)。
小虫子接触DS不过几天时间,实在摸不着头脑,求各位大牛多加指点~~

DS分子对接初学~遇到困难,求帮助。
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DS分子对接初学~遇到困难,求帮助。-1
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DS分子对接初学~遇到困难,求帮助。-2
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珍维永久

金虫 (小有名气)

请问楼主,你的问题后来怎样了??
2楼2015-09-23 10:50:33
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