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yuqufan

木虫 (著名写手)

[求助] 以下步骤正确吗?用Materials studio求水的内聚能密度? 已有1人参与

1画好水分子,点击Modules菜单下Amorphous Cell—Calculation。
2.Setup选项卡中Composition中Molecular中选中结构优化后的H2O.xsd文件,Loading为1,会自动生成盒子的大小。(1个水分子是否合适?)  
3.对AC盒子进行Anneal NVT平衡。
4.Anneal退火。
5.NVT、NPT平衡:NVT、NPT交替跑了5次。
6.NPT跑生产。100帧图。(10ns 100帧图是不是少了点啊?)
7.计算内聚能密度。
但为什么计算出来水的密度为1.2左右,后来调节NPT的压力为0.0001GPa(1个大气压),计算出水的密度仍然是1.2左右?请给予指点!
该步骤有无问题。最好是有高手能将计算的正确过程能详细贴出来。
文献的参数如图中:

以下步骤正确吗?用Materials studio求水的内聚能密度?
1.JPG


以下步骤正确吗?用Materials studio求水的内聚能密度?-1
2.JPG
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

你的是水溶液,是无序结构,盒子里的水分子当然不能是1
我感觉水盒子一般要包含50个以上水分子
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
3楼2015-08-17 08:18:23
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linxiuna

新虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
水的密度用我们的仪器测出来是0.99704

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2015-08-16 21:22:10
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

1个水分子,也只有你做的出来这事
4楼2015-08-17 08:31:40
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yuqufan

木虫 (著名写手)

问题已解决。尝试了一晚上,尝试了各种压力下,得到的密度值,均为1.2左右,表明与压力无关。增加了水分子的个数,将水分子调成100%,盒子尺寸为14.4A*14.4A*14.4A(已知一个水分子的体积为30A,算起来这个盒子好像也不大对),水分子个数未计,但目测好像没有50个(个人也不知道怎么查看水分子个数)。这次计算的值与文献较一致,但计算时长明显加长,要8个小时。以后计算用的分子数目也要注意。
希望各位看贴的人回答完我的问题。另外盒子中水分子的个数怎么看?
5楼2015-08-17 09:48:44
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