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系统发育树和NCBI上的BLAST的结果为什么不太一致？求解
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最初我根据番茄OVATED基因序列找到了，水稻里的OVATE基因，现在克隆得到了OVATE基因，用其核酸序列和蛋白质序列进行BLAST，BLAST的结果对应的都是番茄的OVATE基因，但是在采用相似序列构建系统发育树的时候，与我做的基因最接近的就不是番茄的OVATE基因了，这是为什么啊？两者的结果本就应该是不一样的吗？ 请大神帮忙看看，图1是核酸序列BLAST结果，图2蛋白质序列BLAST结果。图3是已经发表的一篇文章里的发育树，图4是自己做的系统发育树。本来图4中的bbOVATE应该和ovate是最接近的。现在我已经完全搞不懂了  1.jpg  2.jpg  3.jpg  4.jpg |
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2楼2015-08-13 18:11:49