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q904954717

铜虫 (初入文坛)

[求助] 系统发育树和NCBI上的BLAST的结果为什么不太一致?求解

最初我根据番茄OVATED基因序列找到了,水稻里的OVATE基因,现在克隆得到了OVATE基因,用其核酸序列和蛋白质序列进行BLAST,BLAST的结果对应的都是番茄的OVATE基因,但是在采用相似序列构建系统发育树的时候,与我做的基因最接近的就不是番茄的OVATE基因了,这是为什么啊?两者的结果本就应该是不一样的吗?
请大神帮忙看看,图1是核酸序列BLAST结果,图2蛋白质序列BLAST结果。图3是已经发表的一篇文章里的发育树,图4是自己做的系统发育树。本来图4中的bbOVATE应该和ovate是最接近的。现在我已经完全搞不懂了

系统发育树和NCBI上的BLAST的结果为什么不太一致?求解
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系统发育树和NCBI上的BLAST的结果为什么不太一致?求解-1
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系统发育树和NCBI上的BLAST的结果为什么不太一致?求解-2
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系统发育树和NCBI上的BLAST的结果为什么不太一致?求解-3
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q904954717

铜虫 (初入文坛)

对了,除bbOVATE外,发育树里的序列都是番茄里的,是不是一个物种里不能选这么多序列啊?
2楼2015-08-13 18:11:49
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