| 查看: 1404 | 回复: 5 | |||
daixing2011铜虫 (初入文坛)
|
[求助]
Dmol3优化周期结构，如何实现离域内坐标？
|
|
看MS说明书，以及网上的讨论，Dmol3用离域内坐标优化(delocalized internal coordinate)，效率超级快。 但手册上的例子，只是在MS面板上设置任务等等，并没有体现出哪里设置了离域内坐标。 测试了几个手册中的关键词，如Opt_Del_Test, Opt_Bend_Lin,也都无效，程序提示输入错误。 请问，Dmol在周期性优化中怎样实现离域内坐标，还是默认就已经是了？不像吧，输出文件中都是笛卡尔坐标。 另外，做表面吸附的研究，物理吸附，适合用离域内坐标么。 Thanks in advance |
回复此楼» 猜你喜欢
关于filecode，很负责任的告诉大家
已经有7人回复
-
【2027博士申请】纳米药物递送方向
已经有5人回复
-
关于豆爷回答的JTJC与%2F数量
已经有7人回复
-
2026国自然放榜时间
已经有3人回复
-
国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率
已经有7人回复
-
好奇怪的filecode
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有5人回复
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3563.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
2楼2015-08-14 03:38:08
daixing2011
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 127
- 帖子: 26
- 在线: 59.3小时
- 虫号: 1504994
- 注册: 2011-11-22
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
3楼2015-08-15 01:41:46
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3563.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
4楼2015-08-15 01:46:08
daixing2011
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 127
- 帖子: 26
- 在线: 59.3小时
- 虫号: 1504994
- 注册: 2011-11-22
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
|
感谢您再次回复。 您指的“扫描”，是否是逐个做单点能，比如X=Y=10，X=Y=10.5，.....，这样，然后要一个能量最低的？ dmol3优化一个周期表面，我这里一直都出现这样的情况： opt== Cycle Total Energy Energy change Max Gradient Max Displacement opt== tolerance:....... 0.0000100 0.001058 0.009449 opt== 1 -32105.2859592 0.0000000 0.000066 0.000089 Step 1 <-- DELOC <-- DELOC +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- DELOC | Parameter | value | tolerance | units | OK? | <-- DELOC +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- DELOC | delta E | -0.204437E+02 | 0.100000E-04 | Ha | No | <-- DELOC | |F|max | 0.660822E-04 | 0.105835E-02 | au | Yes | <-- DELOC | |dR|max | 0.889212E-04 | 0.944863E-02 | au | Yes | <-- DELOC +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- DELOC Geometry optimization completed successfully in 1 steps. 然后就正常结束了。 很奇怪，delta E 并没有收敛，这是不是几何结构收敛了但晶格没有收敛？为什么还能正常结束呢。 请指点，多谢。 |
5楼2015-08-15 20:31:43
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3563.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
6楼2015-08-15 21:14:41
100