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daixing2011铜虫 (初入文坛)
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Dmol3优化周期结构，如何实现离域内坐标？
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看MS说明书，以及网上的讨论，Dmol3用离域内坐标优化(delocalized internal coordinate)，效率超级快。 但手册上的例子，只是在MS面板上设置任务等等，并没有体现出哪里设置了离域内坐标。 测试了几个手册中的关键词，如Opt_Del_Test, Opt_Bend_Lin,也都无效，程序提示输入错误。 请问，Dmol在周期性优化中怎样实现离域内坐标，还是默认就已经是了？不像吧，输出文件中都是笛卡尔坐标。 另外，做表面吸附的研究，物理吸附，适合用离域内坐标么。 Thanks in advance |
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4楼2015-08-15 01:46:08
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感谢您再次回复。 您指的“扫描”，是否是逐个做单点能，比如X=Y=10，X=Y=10.5，.....，这样，然后要一个能量最低的？ dmol3优化一个周期表面，我这里一直都出现这样的情况： opt== Cycle Total Energy Energy change Max Gradient Max Displacement opt== tolerance:....... 0.0000100 0.001058 0.009449 opt== 1 -32105.2859592 0.0000000 0.000066 0.000089 Step 1 <-- DELOC <-- DELOC +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- DELOC | Parameter | value | tolerance | units | OK? | <-- DELOC +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- DELOC | delta E | -0.204437E+02 | 0.100000E-04 | Ha | No | <-- DELOC | |F|max | 0.660822E-04 | 0.105835E-02 | au | Yes | <-- DELOC | |dR|max | 0.889212E-04 | 0.944863E-02 | au | Yes | <-- DELOC +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- DELOC Geometry optimization completed successfully in 1 steps. 然后就正常结束了。 很奇怪，delta E 并没有收敛，这是不是几何结构收敛了但晶格没有收敛？为什么还能正常结束呢。 请指点，多谢。 |
5楼2015-08-15 20:31:43
