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runye2015

新虫 (小有名气)

[求助] 关于细菌的引物的设计和合成 已有1人参与

最近在做有关肠道细菌方面的实验,用SYBR-GREEN I的方法对多种细菌进行精确定量,目前涉及到合成引物,但是在NCBI里查到的双歧杆菌的序列,结果有很多,是不是查的范围太大了呢?要确定某种菌株吗?我是在临床患者的便样里检测几种细菌,万能的虫友们~帮帮我吧!谢谢各位啦!

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runye2015

新虫 (小有名气)

大家给个建议吧!谢谢!!
2楼2015-08-10 19:33:35
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huhu138

新虫 (初入文坛)

楼主,有没有其他肠道细菌的引物啊,分享一下呗。肠球菌肠杆菌双歧杆菌乳杆菌产气荚膜梭菌的
3楼2015-10-03 22:13:21
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runye2015

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by huhu138 at 2015-10-03 22:13:21
楼主,有没有其他肠道细菌的引物啊,分享一下呗。肠球菌肠杆菌双歧杆菌乳杆菌产气荚膜梭菌的

可以看一看外文的文献,很多!
4楼2015-10-04 00:34:07
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huhu138

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by runye2015 at 2015-10-04 00:34:07
可以看一看外文的文献,很多!...

我现在不太懂,如果说肠球菌肠杆菌双歧杆菌乳杆菌产气荚膜梭菌,那是五种菌呢还是五个属的菌?五个属的话就多了去了。。。。或者说能不能针对不同的属做特异性引物呢?
5楼2015-10-04 23:30:17
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轻风伊始

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by huhu138 at 2015-10-04 23:30:17
我现在不太懂,如果说肠球菌肠杆菌双歧杆菌乳杆菌产气荚膜梭菌,那是五种菌呢还是五个属的菌?五个属的话就多了去了。。。。或者说能不能针对不同的属做特异性引物呢?...

看来你还是个微生物新手,分类的事情先搞清楚吧,看看你是想鉴定到哪个级别,然后可以针对此级别有针对性的设计特异性引物,模板需要选择相应菌群的特异性保守序列,否则无法确定属于哪类菌群,或者说属和种,这就涉及到生物信息学分析,也可从从文献中查找,但未必能找得到,所以,关键是你想检测什么,然后再有针对性的解决问题~

发自小木虫Android客户端
6楼2015-10-04 23:44:26
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