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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 关于细菌的引物的设计和合成
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runye2015

新虫 (小有名气)

[求助] 关于细菌的引物的设计和合成 已有1人参与

最近在做有关肠道细菌方面的实验，用SYBR-GREEN I的方法对多种细菌进行精确定量，目前涉及到合成引物，但是在NCBI里查到的双歧杆菌的序列，结果有很多，是不是查的范围太大了呢？要确定某种菌株吗？我是在临床患者的便样里检测几种细菌，万能的虫友们～帮帮我吧！谢谢各位啦！

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1楼 2015-08-10 14:54:30
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runye2015

新虫 (小有名气)
大家给个建议吧！谢谢！！
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2楼2015-08-10 19:33:35
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huhu138

新虫 (初入文坛)
楼主，有没有其他肠道细菌的引物啊，分享一下呗。肠球菌肠杆菌双歧杆菌乳杆菌产气荚膜梭菌的
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3楼2015-10-03 22:13:21
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runye2015

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by huhu138 at 2015-10-03 22:13:21
楼主，有没有其他肠道细菌的引物啊，分享一下呗。肠球菌肠杆菌双歧杆菌乳杆菌产气荚膜梭菌的

可以看一看外文的文献，很多！
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4楼2015-10-04 00:34:07
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huhu138

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by runye2015 at 2015-10-04 00:34:07
可以看一看外文的文献，很多！...

我现在不太懂，如果说肠球菌肠杆菌双歧杆菌乳杆菌产气荚膜梭菌，那是五种菌呢还是五个属的菌？五个属的话就多了去了。。。。或者说能不能针对不同的属做特异性引物呢？
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5楼2015-10-04 23:30:17
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轻风伊始

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by huhu138 at 2015-10-04 23:30:17
我现在不太懂，如果说肠球菌肠杆菌双歧杆菌乳杆菌产气荚膜梭菌，那是五种菌呢还是五个属的菌？五个属的话就多了去了。。。。或者说能不能针对不同的属做特异性引物呢？...

看来你还是个微生物新手，分类的事情先搞清楚吧，看看你是想鉴定到哪个级别，然后可以针对此级别有针对性的设计特异性引物，模板需要选择相应菌群的特异性保守序列，否则无法确定属于哪类菌群，或者说属和种，这就涉及到生物信息学分析，也可从从文献中查找，但未必能找得到，所以，关键是你想检测什么，然后再有针对性的解决问题～

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6楼2015-10-04 23:44:26
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