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【求助求助】分子小白请教测序和序列有效性方面的问题~~ 已有3人参与
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背景:本人专业生态学,半路被导师拉来做分子。课题主要内容是,通过获得一个未知物种的保守序列(CO1)来鉴定该物种。 问题:CO1基因在进化中相对保守,可以用来物种分类和鉴定。我用上下游引物分别得到一段序列(650bp),然后拼接成一段700bp左右的拼接序列。 问题来了~~~测序结果经常会出现两条序列前几十个碱基双峰。 1、现在物种和两条引物已知,怎样获得该物种两端确定、碱基数确定的CO1基因序列? 2、上下游引物是在CO1基因外两侧进行结合么?如何判断CO1基因两端不在出现双峰的前几十个碱基里? 3、如果不在的话,这样的拼接序列可以用于学术论文发表么? |
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2楼2015-08-10 13:23:13
happy6
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