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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 二代测序为什么有的用G有的用reads代表测序深度？
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

[求助] 二代测序为什么有的用G有的用reads代表测序深度？ 已有1人参与

在对样本进行测序时，例如转录组RNA-seq，测序深度是用 4G、6G或者8G代表。 而small RNA测序则是用 10M reads，20M reads代表测序深度。
问：为什么用reads表示测序深度？ 而不用G了呢？
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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭
1楼 2015-08-06 09:04:43
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stone856

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xingzhou823: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 明白了，谢谢 2015-08-06 13:40:32
small RNA测序则一般用50SE，一条read就可以覆盖一条small RNA。所以有多少reads就证明有多少small RNA被测到了。
一般转录组测序，打断的片段大小是不一样的，而且有时候双端可测通，有时测不通，用read来算的话没有多少意义。还是用数据量来表示。
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2楼2015-08-06 09:43:35
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chenyu600

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
3楼2015-08-08 23:53:55
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