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bbemajj828铜虫 (初入文坛)
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lammps并行版安装问题！cannot find -lfftw是个什么鬼？求教大神... 我快要哭死了... 已有4人参与
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昨天和今天折腾了两天，试着安装lammps的并行版，按照网上的好几个教程都走了一遍，每次都是到最后一步make g++的时候出问题。请教大神，这个问题该怎么弄？ /usr/bin/ld: cannot find -lfftw collect2: error: ld returned 1 exit status make[1]: *** [../lmp_g++] Error 1 make[1]: Leaving directory `/mnt/lammps-30Sep13/src/Obj_g++' make: *** [g++] Error 2 |
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gqs8822837
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【答案】应助回帖
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1. 安装fftw3: (1) 去fftw官网下载最新的tarball (e.g. fftw-3.3.8.tar.gz) (2) 解压fftw的tarball (e.g. sudo tar -xzvf fftw-3.3.8.tar.gz) (3) 进入已解压后的文件夹进行配置: "./configure --prefix=XXX --enable-float --enable-mpi --enable-shared=yes", 其中的XXX就是你想要安装fftw3的路径，我没有选择默认的路径，而是先在/home/<我的用户名>/下创建了一个mysoft的文件夹，在mysoft里面又创建了一个fftw3的文件夹，所以我的配置是"./configure --prefix=/home/<我的用户名>/mysoft/fftw3 --enable-float --enable-mpi --enable-shared=yes" (4) sudo make -j 8 (5) sudo make install (6) 进入/home/<我的用户名>/mysoft/fftw3中查看是不是产生了bin include lib share文件夹 2. 安装OpenMPI: (1) 去OpenMPI官网下载最新的tarball (e.g. openmpi-3.1.2.tar.gz) (2) 解压OpenMPI的tarball (e.g. sudo tar -xzvf openmpi-3.1.2.tar.gz) (3) 进入已解压后的文件夹进行配置: "./configure --prefix=/home/<我的用户名>/mysoft/openmpi", 跟刚才一样，先在mysoft中创建好openmpi文件夹 (4) sudo make -j 8 (5) sudo make install (6) 进入/home/<我的用户名>/mysoft/openmpi中查看是不是产生了bin include lib文件夹 3. 安装lammps: (1) 用git下载lammps: sudo git clone -b stable https://github.com/lammps/lammps.git /home/<我的用户名>/mysoft/lammps (2) 进入lammps/src中，sudo make package-status，sudo make yes-<package name> (3) 进入lammps/src/STUBS中，sudo make (4) 从/src/MAKE/MACHINES中拷贝Makefile.ubuntu: sudo cp /home/<我的用户名>/mysoft/lammps/src/MAKE/MACHINES/Makefile.ubuntu /home/<我的用户名>/mysoft/lammps/src/MAKE/ (5) 修改MAKE文件: sudo vim /home/<我的用户名>/mysoft/lammps/src/MAKE/Makefile.ubuntu，对照下面内容进行更改, "FFT_INC = -DFFT_FFTW3 -I/home/<我的用户名>/mysoft/fftw3/include " "FFT_PATH = -L/home/<我的用户名>/mysoft/fftw3/lib " "FFT_LIB = -lfftw3 " "MPI_INC = -DMPICH_SKIP_MPICXX -DOMPI_SKIP_MPICXX=1 -I/home/<我的用户名>/mysoft/openmpi/include" "MPI_PATH = -L/home/<我的用户名>/mysoft/openmpi/lib" "MPI_LIB = -lmpi -lmpi_cxx" (6) 回到lammps/src文件夹中，sudo make -j8 ubuntu |
8楼2018-09-20 09:39:10
2楼2015-08-04 22:13:01
3楼2015-08-05 15:03:06
bbemajj828
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4楼2015-08-13 21:50:46
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5楼2015-08-13 21:52:10
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6楼2015-08-13 23:46:52
sbkk
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您好，在这篇介绍安装lammps 2018版lammps安装教程（小白专用） http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=12313102&target=1 这里面直接在usr/local安装fftw和mpich，结果按照这篇帖子里面写的内容 /lammps/src/MAKE/MACHINES文件下将Makefile.ubuntu剪切到/lammps/src/MAKE文件夹下 sudo make ubuntu j4 编译失败 /usr/bin/x86_64-linux-gnu-ld: cannot find -lfftw3 collect2: error: ld returned 1 exit status Makefile:93: recipe for target '../lmp_ubuntu' failed make[1]: *** [../lmp_ubuntu] Error 1 make[1]: Leaving directory '/home/xxx/lammps/src/Obj_ubuntu' Makefile:175: recipe for target 'ubuntu' failed make: *** [ubuntu] Error 2 怎么办？？是修改路径么？  |
7楼2018-09-19 23:14:52
sbkk
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您好，按照您的方法执行到最后一步报错  ~/mysoft/lammps/src$ sudo make ubuntu -j8 make[1]: Entering directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src' make[1]: 'lmpinstalledpkgs.h' is up to date. make[1]: Leaving directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src' Compiling LAMMPS for machine ubuntu make[1]: Entering directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src/Obj_ubuntu' ../../lib/quip/Makefile.lammps:17: *** Environment or make variable QUIP_ROOT must be set.. Stop. make[1]: Leaving directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src/Obj_ubuntu' make[1]: Entering directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src/Obj_ubuntu' ../../lib/quip/Makefile.lammps:17: *** Environment or make variable QUIP_ROOT must be set.. Stop. make[1]: Leaving directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src/Obj_ubuntu' Makefile:175: recipe for target 'ubuntu' failed make: *** [ubuntu] Error 2 |
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