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bbemajj828

铜虫 (初入文坛)

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[求助] lammps并行版安装问题！cannot find -lfftw是个什么鬼？求教大神... 我快要哭死了...已有4人参与

昨天和今天折腾了两天，试着安装lammps的并行版，按照网上的好几个教程都走了一遍，每次都是到最后一步make g++的时候出问题。请教大神，这个问题该怎么弄？
/usr/bin/ld: cannot find -lfftw
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[1]: *** [../lmp_g++] Error 1
make[1]: Leaving directory `/mnt/lammps-30Sep13/src/Obj_g++'
make: *** [g++] Error 2

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请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。已经有5人回复

1楼2015-08-04 13:55:47

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gqs8822837

铜虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

1. 安装fftw3:
(1) 去fftw官网下载最新的tarball (e.g. fftw-3.3.8.tar.gz)
(2) 解压fftw的tarball (e.g. sudo tar -xzvf fftw-3.3.8.tar.gz)
(3) 进入已解压后的文件夹进行配置: "./configure --prefix=XXX --enable-float --enable-mpi --enable-shared=yes", 其中的XXX就是你想要安装fftw3的路径，我没有选择默认的路径，而是先在/home/<我的用户名>/下创建了一个mysoft的文件夹，在mysoft里面又创建了一个fftw3的文件夹，所以我的配置是"./configure --prefix=/home/<我的用户名>/mysoft/fftw3 --enable-float --enable-mpi --enable-shared=yes"
(4) sudo make -j 8
(5) sudo make install
(6) 进入/home/<我的用户名>/mysoft/fftw3中查看是不是产生了bin include lib share文件夹

2. 安装OpenMPI:
(1) 去OpenMPI官网下载最新的tarball (e.g. openmpi-3.1.2.tar.gz)
(2) 解压OpenMPI的tarball (e.g. sudo tar -xzvf openmpi-3.1.2.tar.gz)
(3) 进入已解压后的文件夹进行配置: "./configure --prefix=/home/<我的用户名>/mysoft/openmpi", 跟刚才一样，先在mysoft中创建好openmpi文件夹
(4) sudo make -j 8
(5) sudo make install
(6) 进入/home/<我的用户名>/mysoft/openmpi中查看是不是产生了bin include lib文件夹

3. 安装lammps:
(1) 用git下载lammps: sudo git clone -b stable https://github.com/lammps/lammps.git /home/<我的用户名>/mysoft/lammps
(2) 进入lammps/src中，sudo make package-status，sudo make yes-<package name>
(3) 进入lammps/src/STUBS中，sudo make
(4) 从/src/MAKE/MACHINES中拷贝Makefile.ubuntu:
sudo cp /home/<我的用户名>/mysoft/lammps/src/MAKE/MACHINES/Makefile.ubuntu /home/<我的用户名>/mysoft/lammps/src/MAKE/
(5) 修改MAKE文件: sudo vim /home/<我的用户名>/mysoft/lammps/src/MAKE/Makefile.ubuntu，对照下面内容进行更改,
"FFT_INC =    -DFFT_FFTW3 -I/home/<我的用户名>/mysoft/fftw3/include "
"FFT_PATH =    -L/home/<我的用户名>/mysoft/fftw3/lib                "
"FFT_LIB =    -lfftw3                         "

"MPI_INC =    -DMPICH_SKIP_MPICXX -DOMPI_SKIP_MPICXX=1 -I/home/<我的用户名>/mysoft/openmpi/include"
"MPI_PATH = -L/home/<我的用户名>/mysoft/openmpi/lib"
"MPI_LIB = -lmpi -lmpi_cxx"
(6) 回到lammps/src文件夹中，sudo make -j8 ubuntu