24小时热门版块排行榜    

查看: 2405  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xiao_qft

新虫 (初入文坛)

[求助] 为何三线态氧分子(Triplet-O2)势能面扫描PES曲线存在断点? 已有1人参与

输入文件为(三线态):
%mem=1920MB
%nprocshared=8
#T B3LYP/aug-cc-pVQZ Scan Test

O2 PES Scan

0 3
O
O 1 R

R 0.8 84 0.05

单线态仅3改为1(其它不变):
%mem=1920MB
%nprocshared=8
#T B3LYP/aug-cc-pVQZ Scan Test

O2 PES Scan

0 1
O
O 1 R

R 0.8 84 0.05

结果附件图片。

哪儿出的问题?谢谢

为何三线态氧分子(Triplet-O2)势能面扫描PES曲线存在断点?
O2-PES.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

virtualzx

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiao_qft: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-08-04 16:53:50
这里你的两个曲线都不对,O2解离能应该是0.26hartree左右,这俩都太高。三线态和单线态在解离处应该是简并的,你这里能量不同。
单线态是闭壳层计算,因此没法正确描述解离后的开壳层结构(解离后有四个未成对电子)

用unrestrict 方法进行解离计算经常会得到由于自旋污染造成的间断点,即使是基态也会有断点,称为 Coulson–Fischer点(Phys. Rev. B 13, 4274),这个点之后出现对称破缺解。因此最好用Restricted Open-shell来算。当然要真正正确的结果就最好进行多组态计算。

另外键解离要从远到近扫描,否则即使没有自旋耦合,断点也很常见,即使没有断点,也往往得到错误的能量曲线。扫描时是用前一个点的轨道作为下一个点的初始猜测的,解离时化学键重点电子从成对到不成对,程序往往无法及时发现。所以从远到近扫描。首先在远处进行单点计算,查看轨道,正确之后从这里开始向短处进行扫描。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2015-08-01 01:35:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

xiao_qft

新虫 (初入文坛)

从log文件中看到断点前后有如下信息:

断点前:
<Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 1.0000 <S**2>= 2.0153 S= 1.0051
<L.S>= 0.000000000000E+00
Annihilation of the first spin contaminant:
S**2 before annihilation     2.0153,   after     2.0001

断点后:
<Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 1.0000 <S**2>= 3.0138 S= 1.3066
<L.S>= 0.000000000000E+00
Annihilation of the first spin contaminant:
S**2 before annihilation     3.0138,   after     2.0279

该如何处理?
2楼2015-07-31 14:44:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiao_qft

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by virtualzx at 2015-08-01 01:35:01
这里你的两个曲线都不对,O2解离能应该是0.26hartree左右,这俩都太高。三线态和单线态在解离处应该是简并的,你这里能量不同。
单线态是闭壳层计算,因此没法正确描述解离后的开壳层结构(解离后有四个未成对电子 ...

本人量化新手,您的回复是否表明对于O2分子,简单的Gaussian Scan关键字是无法得到正确的PES的?

按您的提示,采用由远及近扫描、以及改为ROB3LYP关键字
对于单线态O2:
1、B3LYP&正向扫描 2、B3LYP&反向扫描 3、ROB3LYP&反向扫描 三个方法获得的PES完全重合

对于三线态O2:
1、B3LYP&正向扫描 2、B3LYP&反向扫描 两个方法获得的PES仅仅是间断点移位,如下图
3、ROB3LYP&反向扫描 无法获得结果,见下log文件
Convergence failure -- run terminated.
Error termination via Lnk1e in /home/gate/GAUSSIAN/g09/l502.exe

“O2解离能应该是0.26hartree左右”
至少对于基态Triplet-O2,Gaussian 输入文件该如何编写才能得到正确的结果?

谢谢!
为何三线态氧分子(Triplet-O2)势能面扫描PES曲线存在断点?-1
O2-Tripelet_Reverse_Scan.png

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : O2T_PES_03.log
  • 2015-08-03 14:14:46, 17.29 K
4楼2015-08-03 14:18:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiao_qft

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by virtualzx at 2015-08-01 01:35:01
这里你的两个曲线都不对,O2解离能应该是0.26hartree左右,这俩都太高。三线态和单线态在解离处应该是简并的,你这里能量不同。
单线态是闭壳层计算,因此没法正确描述解离后的开壳层结构(解离后有四个未成对电子 ...

采用CAS进行Scan计算,输入文件如下:
%mem=1920MB
%nprocshared=8
#T CAS(4,4)/3-21+G Scan Test

O2 PES Scan

0 3
O
O 1 R

R 10.0 184 -0.05

结果如下图

E(10.00)-E(1.25)=0.3hartree
间断点也基本消失了

上述计算是否正确?该如何进一步改进?CAS中的活化电子数/活化轨道数针对O2该如何设置?该方法是否也能计算Singlet-O2的PES(尝试过,报Convergence failure)?
为何三线态氧分子(Triplet-O2)势能面扫描PES曲线存在断点?-2
Triplet-O2-CAS-SCAN-PES.png

5楼2015-08-03 17:48:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 6/300 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +5 Ldrop2023 2026-08-13 5/250 2026-08-14 18:48 by ssxclkj
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +6 majunge000 2026-08-11 8/400 2026-08-14 14:44 by 医学老男孩
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +5 工厂打螺丝 2026-08-08 5/250 2026-08-14 11:03 by 玖戈弋
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +10 Tide man 2026-08-10 11/550 2026-08-14 10:30 by 沁言学术
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
信息提示
请填处理意见