应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 使用autodock做分子对接，有金属离子Na,该如何添加相关参数？
101/1返回列表
查看: 5707  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

五月之青青

金虫 (小有名气)

[求助] 使用autodock做分子对接，有金属离子Na,该如何添加相关参数？ 已有1人参与

受体蛋白有金属离子Na,用Autodock对接，提示
unknown recepter type:"Na"
---add parameters for it to the parameter library first！
找到了Na的参数，可是不知道怎么添加到parameter library，该怎样解决这个问题呢？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2015-07-27 10:11:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
五月之青青: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-07-28 13:52:15
找ADT-paramter.dat ，然后添加金属Na离子参数
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2015-07-28 10:52:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

五月之青青

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2015-07-28 10:52:06
找ADT-paramter.dat ，然后添加金属Na离子参数

多谢
回复此楼
3楼2015-07-28 13:52:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Rollkin

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 五月之青青 at 2015-07-28 13:52:26
多谢...

请问楼主怎么解决的
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2018-04-18 15:16:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wkdpwc

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Rollkin at 2018-04-18 15:16:37
请问楼主怎么解决的...

Hello 你怎么添加金属离子参数的？我最近也在做分子对接，不知道怎么处理金属离子
赞一下 回复此楼
5楼2018-06-05 20:08:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

whhvaliant

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 五月之青青 at 2015-07-28 09:52:26
多谢...

请问楼主找到了ADT-paramter.dat ，用WinHex打开了，去哪儿找金属的参数文件，怎么添加？
感激不尽！！！
赞一下 回复此楼
6楼2018-10-18 16:25:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

whhvaliant

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Rollkin at 2018-04-18 11:16:37
请问楼主怎么解决的...

请问您解决了吗
回复此楼
7楼2018-10-22 14:50:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张雨欣

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 五月之青青 at 2015-07-28 13:52:26
多谢...

你好  请问 在哪里改参数 可以具体一点吗
赞一下 回复此楼
8楼2019-09-03 16:47:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张雨欣

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by whhvaliant at 2018-10-18 16:25:12
请问楼主找到了ADT-paramter.dat ，用WinHex打开了，去哪儿找金属的参数文件，怎么添加？
感激不尽！！！...

同学  在哪里可以找到  可以详细说明一下吗
赞一下 回复此楼
9楼2019-09-03 16:49:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

孤狼1

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 张雨欣 at 2019-09-03 16:49:15
同学  在哪里可以找到  可以详细说明一下吗...

您好，我想问一下用autokock做分子对接，那个金属原子的参数从哪可以找到？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
10楼2021-03-24 12:17:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 五月之青青 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +16 羊腰板 2026-08-21 17/850 2026-08-23 23:02 by tianxiaochun
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +12 大萍1987 2026-08-20 15/750 2026-08-23 20:44 by 大萍1987
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭