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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 使用autodock做分子对接，有金属离子Na,该如何添加相关参数？
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五月之青青

金虫 (小有名气)

[求助] 使用autodock做分子对接，有金属离子Na,该如何添加相关参数？ 已有1人参与

受体蛋白有金属离子Na,用Autodock对接，提示
unknown recepter type:"Na"
---add parameters for it to the parameter library first！
找到了Na的参数，可是不知道怎么添加到parameter library，该怎样解决这个问题呢？
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1楼 2015-07-27 10:11:09
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
五月之青青: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-07-28 13:52:15
找ADT-paramter.dat ，然后添加金属Na离子参数
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2楼2015-07-28 10:52:06
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五月之青青

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2015-07-28 10:52:06
找ADT-paramter.dat ，然后添加金属Na离子参数

多谢
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3楼2015-07-28 13:52:26
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Rollkin

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 五月之青青 at 2015-07-28 13:52:26
多谢...

请问楼主怎么解决的
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4楼2018-04-18 15:16:37
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wkdpwc

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Rollkin at 2018-04-18 15:16:37
请问楼主怎么解决的...

Hello 你怎么添加金属离子参数的？我最近也在做分子对接，不知道怎么处理金属离子
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5楼2018-06-05 20:08:59
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whhvaliant

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 五月之青青 at 2015-07-28 09:52:26
多谢...

请问楼主找到了ADT-paramter.dat ，用WinHex打开了，去哪儿找金属的参数文件，怎么添加？
感激不尽！！！
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6楼2018-10-18 16:25:12
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whhvaliant

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Rollkin at 2018-04-18 11:16:37
请问楼主怎么解决的...

请问您解决了吗
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7楼2018-10-22 14:50:04
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张雨欣

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 五月之青青 at 2015-07-28 13:52:26
多谢...

你好  请问 在哪里改参数 可以具体一点吗
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8楼2019-09-03 16:47:58
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张雨欣

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by whhvaliant at 2018-10-18 16:25:12
请问楼主找到了ADT-paramter.dat ，用WinHex打开了，去哪儿找金属的参数文件，怎么添加？
感激不尽！！！...

同学  在哪里可以找到  可以详细说明一下吗
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9楼2019-09-03 16:49:15
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孤狼1

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 张雨欣 at 2019-09-03 16:49:15
同学  在哪里可以找到  可以详细说明一下吗...

您好，我想问一下用autokock做分子对接，那个金属原子的参数从哪可以找到？

发自小木虫Android客户端
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10楼2021-03-24 12:17:15
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