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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 使用AutoDock做分子对接，该如何确定蛋白质活性部位？
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五月之青青

金虫 (小有名气)

[求助] 使用AutoDock做分子对接，该如何确定蛋白质活性部位？ 已有1人参与

使用AutoDock做分子对接，该如何确定蛋白质活性部位？看过有些帖子说可以看相关文献上的，可是这种办法行不通。还有其他什么办法吗？有没有什么软件可以用来自动确定的？多谢
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1楼 2015-07-26 17:28:35
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五月之青青

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2015-07-27 08:51:50
你的研究蛋白有没有晶体结构？还是通过同源建模获得的

通过同源建模获得的，而且有金属离子Na,用Autodock对接，提示
unknown recepter type:"Na"
---add parameters for it to the parameter library first！
找到了Na的参数，可是不知道怎么添加到parameter library，该怎样解决这个问题呢？
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3楼2015-07-27 10:07:11
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longdlut

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五月之青青: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-07-27 10:07:20
你的研究蛋白有没有晶体结构？还是通过同源建模获得的
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2楼2015-07-27 08:51:50
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