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五月之青青

金虫 (小有名气)

应助: 5 (幼儿园)
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注册: 2013-11-05
专业: 合成药物化学

[求助] 使用AutoDock做分子对接，该如何确定蛋白质活性部位？已有1人参与

使用AutoDock做分子对接，该如何确定蛋白质活性部位？看过有些帖子说可以看相关文献上的，可是这种办法行不通。还有其他什么办法吗？有没有什么软件可以用来自动确定的？多谢

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1楼 2015-07-26 17:28:35

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

五月之青青

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专业: 合成药物化学

引用回帖:

2楼: Originally posted by longdlut at 2015-07-27 08:51:50
你的研究蛋白有没有晶体结构？还是通过同源建模获得的

通过同源建模获得的，而且有金属离子Na,用Autodock对接，提示
unknown recepter type:"Na"
---add parameters for it to the parameter library first！
找到了Na的参数，可是不知道怎么添加到parameter library，该怎样解决这个问题呢？