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五月之青青

金虫 (小有名气)

[求助] 使用AutoDock做分子对接,该如何确定蛋白质活性部位? 已有1人参与

使用AutoDock做分子对接,该如何确定蛋白质活性部位?看过有些帖子说可以看相关文献上的,可是这种办法行不通。还有其他什么办法吗?有没有什么软件可以用来自动确定的?多谢
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longdlut

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五月之青青: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-07-27 10:07:20
你的研究蛋白有没有晶体结构?还是通过同源建模获得的
2楼2015-07-27 08:51:50
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五月之青青

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2015-07-27 08:51:50
你的研究蛋白有没有晶体结构?还是通过同源建模获得的

通过同源建模获得的,而且有金属离子Na,用Autodock对接,提示
unknown recepter type:"Na"
---add parameters for it to the parameter library first!
找到了Na的参数,可是不知道怎么添加到parameter library,该怎样解决这个问题呢?
3楼2015-07-27 10:07:11
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