应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 在NCBI中知道蛋白序列，如何找到该基因的上下游序列？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 3588  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

syn1985

木虫 (正式写手)

[求助] 在NCBI中知道蛋白序列，如何找到该基因的上下游序列？ 已有1人参与

小虫我是做链霉菌的，NCBI里面有很多相关的基因组信息，我想看看Streptomyces sp. Amel2xE9的WP_019980710.1蛋白对应的基因组中的上下游核苷酸序列，该菌株基因组信息已经公布了，但是数据太庞大了，不知道该如何找到想要的信息，跪求各位大牛
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-07-22 15:21:00
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

syn1985

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-07-22 17:22:31
选择tblastn程序，database选择refseq-genomic，搜索框中输入该蛋白序列或直接输入该蛋白的登录号WP_019980710，在下面organism框中输入该菌株名称，点击blast，结果的第一条就是该蛋白对应的核酸序列，查看第一条比 ...

谢谢stone2239的热心解答，我自己也找到了一种办法：直接在NCBI中输入该蛋白的登录号WP_019980710，出来的界面为蛋白序列，在该界面的Related information里面有一个是Nucleotide，点进去就是了。
赞一下 回复此楼
3楼2015-07-22 18:32:22
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-07-22 17:39:21
syn1985: 金币+30, ★★★很有帮助 2015-07-22 18:32:21
选择tblastn程序，database选择refseq-genomic，搜索框中输入该蛋白序列或直接输入该蛋白的登录号WP_019980710，在下面organism框中输入该菌株名称，点击blast，结果的第一条就是该蛋白对应的核酸序列，查看第一条比对结果，可以看到，该蛋白在该核酸序列中的对应位置是81011-71259，而该段核酸总长度为256256，下载该序列，蛋白对应序列上下游序列就都有了。
赞一下 回复此楼
2楼2015-07-22 17:22:31
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600，材料与化工321分，求调剂 +13 大馋小子 2026-03-27 13/650 2026-04-02 10:48 by sanrepian
[考研] 考研调剂0702 +3 梅子味晚霞 2026-03-28 3/150 2026-04-02 10:10 by jp9609
[考研] 333求调剂 +3 12138。、m?x?b 2026-03-26 4/200 2026-04-02 09:58 by olim
[考研] 070300一志愿211，312分求调剂院校 +14 小黄鸭宝 2026-03-30 14/700 2026-04-01 20:19 by 赖春艳
[考研] 调剂 +5 好好读书。 2026-03-28 7/350 2026-04-01 15:32 by 王亮_大连医科大
[考研] 求调剂 +5 零八# 2026-03-27 5/250 2026-04-01 14:40 by yulian1987
[考研] 环境工程调剂 +9 hyzzzzzzz. 2026-04-01 9/450 2026-04-01 14:20 by salamander`
[考研] 环境工程 085701，267求调剂 +15 minht 2026-03-29 16/800 2026-04-01 10:13 by li_sujuan99
[考研] 一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕 +10 @taotao 2026-03-31 11/550 2026-04-01 09:43 by xiayizhi
[考研] 一志愿北京科技大学085601材料工程英一数二初试总分335求调剂 +5 双马尾痞老板2 2026-03-31 5/250 2026-04-01 09:04 by oooqiao
[考研] 调剂申请 +8 张张张张zy 2026-03-31 9/450 2026-04-01 08:29 by zjbkx
[考研] 318求调剂 +10 陈晨79 2026-03-30 10/500 2026-03-31 17:37 by 544594351
[考研] 282求调剂 +3 呼吸都是减肥 2026-03-31 3/150 2026-03-31 10:00 by wangjy2002
[考研] 085600 286分 材料求调剂 +11 麻辣鱿鱼 2026-03-27 12/600 2026-03-30 19:33 by Wang200018
[考研] 抱歉 +3 田洪有 2026-03-30 3/150 2026-03-30 19:11 by 迷糊CCPs
[考研] 322求调剂 +10 宋明欣 2026-03-27 10/500 2026-03-30 18:47 by 544594351
[考研] 356求调剂 +4 gysy?s?a 2026-03-28 4/200 2026-03-29 10:32 by 唐沐儿
[硕博家园] 招收生物学/细胞生物学调剂 +4 IceGuo 2026-03-26 5/250 2026-03-29 01:25 by griffith2014
[考研] 081200-314 +3 LILIQQ 2026-03-27 4/200 2026-03-28 09:41 by 保护地球你我做�
[考研] 341求调剂 +7 青柠檬1 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:19 by wxiongid
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭