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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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ankey呦

新虫 (初入文坛)

[求助] 乳酸菌同源重组基因敲除PCR验证求救 已有2人参与

本人做乳酸菌基因敲除,采用同源重组方法,敲除目的基因的同时引入抗性基因,筛选到了一株疑似突变菌,但在pcr验证基因组时,总是既出现突变后的条带3400bp,也有正常菌的条带2800bp,即使纯化四代了提取基因组也一样,而正常菌只有2800,有高手前辈明白原因么?是菌还是不纯?还是菌能够自己修复回原来的基因?急求前辈指点啊!谢谢!
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yangtzelv

新虫 (小有名气)

可能同源整合到了其它位点。
6楼2015-12-18 15:45:01
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查看全部 7 个回答

红塔山和云烟

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ankey呦(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-19 20:06:25
楼主应当将PCR鉴定引物设置在你的目的基因外,如果鉴定引物是与你的目的基因互搭的话就会出现楼主上述的情况(即扩增出重组后的条带,也有原始长度的条带),希望能帮助到你
2楼2015-07-19 14:47:26
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ankey呦

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 红塔山和云烟 at 2015-07-19 14:47:26
楼主应当将PCR鉴定引物设置在你的目的基因外,如果鉴定引物是与你的目的基因互搭的话就会出现楼主上述的情况(即扩增出重组后的条带,也有原始长度的条带),希望能帮助到你

非常感谢您的帮助,目前我的引物就是设计在同源臂外侧的基因组上的,如果未突变应该不会有3400的条带啊,只是不明白为什么每次挑取单菌落培养后的菌PCR既有突变的3400又有正常菌的2800?能指点下吗?谢谢!
3楼2015-07-19 16:44:50
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红塔山和云烟

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
ankey呦: 金币+4, 有帮助, 非常感谢您的建议 2015-07-20 09:15:16
引用回帖:
3楼: Originally posted by ankey呦 at 2015-07-19 16:44:50
非常感谢您的帮助,目前我的引物就是设计在同源臂外侧的基因组上的,如果未突变应该不会有3400的条带啊,只是不明白为什么每次挑取单菌落培养后的菌PCR既有突变的3400又有正常菌的2800?能指点下吗?谢谢!...

这种情况在大肠杆菌里也遇到过,楼主可以试试回收3400的片段 然后送去测序一下 如果测序结果表明突变成功应该就没有问题 也有可能没挑到单菌落.

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2015-07-19 20:33:40
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