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chemred

新虫 (初入文坛)

[求助] 金属有机化合物高斯计算 已有2人参与

新手入门， 捣鼓了好久了，还没有一个满意的结果，时间比较紧张，哪位哪位热心人士帮忙计算一个有机金属配合物的结构优化，想要知道它的能量最优构型以及有机金属配合物分子的HOMO/LUMO轨道分布。感谢。
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  • 附件 1 : 配合物结构.doc
    • 2015-07-16 15:44:34, 16.5 K

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1楼 2015-07-16 15:44:38
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oinkmasta

金虫 (小有名气)
结构不满意是高斯报错？还是算出来的部分数据不符合实验结果？
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16届本科在北美
2楼2015-07-16 21:15:06
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chemred

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by oinkmasta at 2015-07-16 21:15:06
结构不满意是高斯报错？还是算出来的部分数据不符合实验结果？

九成是“502”不收敛的问题而终止，只是正常结束过一个，但是输出文件用GV打开，关键部位的连接方式发生了改变，原本成键的两原子间距离老远。我用的是DFT、B3YLP、63-1g*或LAN2DZ。
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3楼2015-07-17 08:58:11
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oinkmasta

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
502不收敛，试试scf=(xqc,maxcycle=500)。键如果需要强制保持，可以用opt=modredundant和冻结。
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16届本科在北美
4楼2015-07-18 08:17:01
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你实验上已经得到这个结构了？

不收敛什么的其实主要还是因为初始结构不合理造成的

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5楼2015-07-18 08:27:15
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chemred

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by qchem at 2015-07-18 08:27:15
你实验上已经得到这个结构了？

不收敛什么的其实主要还是因为初始结构不合理造成的

没有实验验证猜想结构的正确与否，依文献和经验所得
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6楼2015-07-18 09:27:33
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kong890109

金虫 (小有名气)
你猜这个化合物结构好像不太合适
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7楼2015-07-18 11:25:50
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by chemred at 2015-07-18 09:27:33
没有实验验证猜想结构的正确与否，依文献和经验所得...

那如果老算不来，可能你的猜测有点问题

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8楼2015-07-18 21:05:38
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jjww0001

金虫 (小有名气)
丢掉金属离子先优化有机物构型，然后再把离子加回去优化试试

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9楼2015-07-19 09:52:32
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chemred

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by jjww0001 at 2015-07-19 09:52:32
丢掉金属离子先优化有机物构型，然后再把离子加回去优化试试

谢谢你的回复，马上一试。但问题是：优化后，金属离子怎么加回去？我一般是先画好chemdraw,然后画chen3D,再用高斯打开PDB文件进行计算。是否可以对优化好的有机配体的输出文件，用GV打开，再加金属离子？
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10楼2015-07-19 18:51:10
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