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chemred

新虫 (初入文坛)

[求助] 金属有机化合物高斯计算 已有2人参与

新手入门, 捣鼓了好久了,还没有一个满意的结果,时间比较紧张,哪位哪位热心人士帮忙计算一个有机金属配合物的结构优化,想要知道它的能量最优构型以及有机金属配合物分子的HOMO/LUMO轨道分布。感谢。
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  • 附件 1 : 配合物结构.doc
  • 2015-07-16 15:44:34, 16.5 K

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oinkmasta

金虫 (小有名气)

结构不满意是高斯报错?还是算出来的部分数据不符合实验结果?
16届本科在北美
2楼2015-07-16 21:15:06
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chemred

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by oinkmasta at 2015-07-16 21:15:06
结构不满意是高斯报错?还是算出来的部分数据不符合实验结果?

九成是“502”不收敛的问题而终止,只是正常结束过一个,但是输出文件用GV打开,关键部位的连接方式发生了改变,原本成键的两原子间距离老远。我用的是DFT、B3YLP、63-1g*或LAN2DZ。
3楼2015-07-17 08:58:11
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oinkmasta

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
502不收敛,试试scf=(xqc,maxcycle=500)。键如果需要强制保持,可以用opt=modredundant和冻结。
16届本科在北美
4楼2015-07-18 08:17:01
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你实验上已经得到这个结构了?

不收敛什么的其实主要还是因为初始结构不合理造成的

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2015-07-18 08:27:15
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chemred

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by qchem at 2015-07-18 08:27:15
你实验上已经得到这个结构了?

不收敛什么的其实主要还是因为初始结构不合理造成的

没有实验验证猜想结构的正确与否,依文献和经验所得
6楼2015-07-18 09:27:33
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kong890109

金虫 (小有名气)

你猜这个化合物结构好像不太合适
7楼2015-07-18 11:25:50
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by chemred at 2015-07-18 09:27:33
没有实验验证猜想结构的正确与否,依文献和经验所得...

那如果老算不来,可能你的猜测有点问题

[ 发自小木虫客户端 ]
8楼2015-07-18 21:05:38
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jjww0001

金虫 (小有名气)

丢掉金属离子先优化有机物构型,然后再把离子加回去优化试试

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2015-07-19 09:52:32
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chemred

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by jjww0001 at 2015-07-19 09:52:32
丢掉金属离子先优化有机物构型,然后再把离子加回去优化试试

谢谢你的回复,马上一试。但问题是:优化后,金属离子怎么加回去?我一般是先画好chemdraw,然后画chen3D,再用高斯打开PDB文件进行计算。是否可以对优化好的有机配体的输出文件,用GV打开,再加金属离子?
10楼2015-07-19 18:51:10
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