| 查看: 2018 | 回复: 7 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
xuezheng6533铁杆木虫 (正式写手)
|
[求助]
求助，分子晶体形貌模拟！急！
|
|||
|
一个卟啉分子，只有晶胞参数，我想在MS中Build -> Build Crystal，尝试不同的空间群，之后再Modules->Morphology->Calculation中模拟晶体形态吗？ 我使用BFDH可以得到形态，但是使用Growth morphology却得不到形态。 总是出现“WARNING: The growth rate calculation found one or more unstable crystal surfaces. Check the lattice energy, it should be negative for a stable crystal structure. If it is not you may be using an unsuitable forcefield for the crystal under consideration or you may have an unstable or an unoptimized crystal structure.” 怎么解决啊？ 这种模拟分子怎么先优化一下啊？ |
回复此楼» 猜你喜欢
317求调剂
已经有7人回复
-
复试调剂，一志愿南农083200食品科学与工程
已经有4人回复
-
一志愿太原理工安全工程300分，求调剂
已经有3人回复
-
284求调剂
已经有11人回复
-
食品工程专硕求调剂
已经有3人回复
-
324求调剂
已经有7人回复
-
一志愿武汉理工，总分321，英一数二，求老师收留。
已经有4人回复
-
287求调剂
已经有7人回复
-
325求调剂
已经有5人回复
-
343求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 晶体模拟与原子轨道计算问题求助
已经有1人回复
- 【求助】《新结构高性能多孔催化材料》
已经有14人回复
pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
-
专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
- 金币: 10371
- 散金: 3286
- 红花: 166
- 帖子: 2101
- 在线: 1968.4小时
- 虫号: 1463681
- 注册: 2011-10-27
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
跨度好大啊 我现在手上没软件，没记错的话是右键display可以找到晶面指数的显示选项 
8楼2017-12-25 08:17:02
pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
-
专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
- 金币: 10371
- 散金: 3286
- 红花: 166
- 帖子: 2101
- 在线: 1968.4小时
- 虫号: 1463681
- 注册: 2011-10-27
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
★ ★ ★ ★ ★
xuezheng6533(月只蓝代发): 金币+5, 感谢指导！ 2015-07-17 13:45:32
xuezheng6533(月只蓝代发): 金币+5, 感谢指导！ 2015-07-17 13:45:32
|
我觉得提示说的很清楚 你现在的结构不稳定，可以的操作是换个力场，或者先结构优化 结构优化的话挑forcite或者dmol、高斯什么的，看你需要 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
xuezheng65332楼2015-07-17 10:49:30
xuezheng6533
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 6307.7
- 散金: 96
- 帖子: 776
- 在线: 785.3小时
- 虫号: 939597
- 注册: 2010-01-09
- 性别: GG
- 专业: 胶体与界面化学
3楼2015-07-17 14:31:51
pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
-
专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
- 金币: 10371
- 散金: 3286
- 红花: 166
- 帖子: 2101
- 在线: 1968.4小时
- 虫号: 1463681
- 注册: 2011-10-27
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
|
morphology用的是晶体结构，所以是优化 卟啉晶体 结构文件 forcite的话可以挑个dreiding、pcff力场试试 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
4楼2015-07-17 15:10:48
