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xuezheng6533铁杆木虫 (正式写手)
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[求助]
求助，分子晶体形貌模拟！急！
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一个卟啉分子，只有晶胞参数，我想在MS中Build -> Build Crystal，尝试不同的空间群，之后再Modules->Morphology->Calculation中模拟晶体形态吗？ 我使用BFDH可以得到形态，但是使用Growth morphology却得不到形态。 总是出现“WARNING: The growth rate calculation found one or more unstable crystal surfaces. Check the lattice energy, it should be negative for a stable crystal structure. If it is not you may be using an unsuitable forcefield for the crystal under consideration or you may have an unstable or an unoptimized crystal structure.” 怎么解决啊？ 这种模拟分子怎么先优化一下啊？ |
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morphology用的是晶体结构，所以是优化 卟啉晶体 结构文件 forcite的话可以挑个dreiding、pcff力场试试 |
xuezheng6533
4楼2015-07-17 15:10:48
pigrass
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xuezheng6533(月只蓝代发): 金币+5, 感谢指导！ 2015-07-17 13:45:32
xuezheng6533(月只蓝代发): 金币+5, 感谢指导！ 2015-07-17 13:45:32
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我觉得提示说的很清楚 你现在的结构不稳定，可以的操作是换个力场，或者先结构优化 结构优化的话挑forcite或者dmol、高斯什么的，看你需要 |
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2楼2015-07-17 10:49:30
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5楼2015-07-17 16:31:49
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