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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 求助，分子晶体形貌模拟！急！
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xuezheng6533

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 求助，分子晶体形貌模拟！急！

一个卟啉分子，只有晶胞参数，我想在MS中Build -> Build Crystal，尝试不同的空间群，之后再Modules->Morphology->Calculation中模拟晶体形态吗？
我使用BFDH可以得到形态，但是使用Growth morphology却得不到形态。
总是出现“WARNING: The growth rate calculation found one or more unstable crystal surfaces.
Check the lattice energy, it should be negative for a stable crystal structure.
If it is not you may be using an unsuitable forcefield for the crystal under
consideration or you may have an unstable or an unoptimized crystal structure.”
怎么解决啊？
这种模拟分子怎么先优化一下啊？
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1楼 2015-07-16 10:27:56
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★ ★ ★ ★ ★
xuezheng6533(月只蓝代发): 金币+5, 感谢指导！ 2015-07-17 13:45:32
我觉得提示说的很清楚
你现在的结构不稳定，可以的操作是换个力场，或者先结构优化
结构优化的话挑forcite或者dmol、高斯什么的，看你需要
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xuezheng6533
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2015-07-17 10:49:30
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xuezheng6533

铁杆木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2015-07-17 10:49:30
我觉得提示说的很清楚
你现在的结构不稳定，可以的操作是换个力场，或者先结构优化
结构优化的话挑forcite或者dmol、高斯什么的，看你需要

麻烦问一下，我是优化分子还是晶胞？如果优化晶胞的话，该怎么做？我就是需要它能量最低最稳定即可，优化分子用高斯正在做
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3楼2015-07-17 14:31:51
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
3楼: Originally posted by xuezheng6533 at 2015-07-17 14:31:51
麻烦问一下，我是优化分子还是晶胞？如果优化晶胞的话，该怎么做？我就是需要它能量最低最稳定即可，优化分子用高斯正在做...

morphology用的是晶体结构，所以是优化 卟啉晶体 结构文件
forcite的话可以挑个dreiding、pcff力场试试
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xuezheng6533
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2015-07-17 15:10:48
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xuezheng6533

铁杆木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2015-07-17 15:10:48
morphology用的是晶体结构，所以是优化 卟啉晶体 结构文件
forcite的话可以挑个dreiding、pcff力场试试...

谢谢，我试一下
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5楼2015-07-17 16:31:49
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江上圆月

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2015-07-17 15:10:48
morphology用的是晶体结构，所以是优化 卟啉晶体 结构文件
forcite的话可以挑个dreiding、pcff力场试试...

你好，麻烦问一下，BFDG怎么样晶面指数表到晶面上面，需要自己手动表吗？

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6楼2017-12-24 15:21:32
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江上圆月

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2015-07-17 10:49:30
我觉得提示说的很清楚
你现在的结构不稳定，可以的操作是换个力场，或者先结构优化
结构优化的话挑forcite或者dmol、高斯什么的，看你需要

你好麻烦问一下，晶面指数怎么样标到模拟出来的晶体上，谢谢，，，

发自小木虫Android客户端
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7楼2017-12-24 15:23:58
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
7楼: Originally posted by 江上圆月 at 2017-12-24 15:23:58
你好麻烦问一下，晶面指数怎么样标到模拟出来的晶体上，谢谢，，，
...

  跨度好大啊 我现在手上没软件，没记错的话是右键display可以找到晶面指数的显示选项
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
8楼2017-12-25 08:17:02
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