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watcher0821新虫 (初入文坛)
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[求助]
关于ZINC数据库下载小分子进行对接的问题 已有3人参与
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| 我是虚拟筛选的初级选手，想请教一下有经验的大侠们，我在ZINC数据库中的lead-like和fragment-like里下载的小分子，是一个mol2文件中有无数个小分子，我提取50个小分子保存在一个mol2文件里，在AUTODOCK里面对接报错，打算对接600个小分子又不可能一个一个的保存，我是不是应该把有多个小分子的文件转化成一个文件里只有一个小分子的格式，该用什么转化怎么转换，谢谢啦~ |
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 autodock |
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7楼2017-10-29 09:59:01
therotyonth
金虫 (正式写手)
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- 注册: 2013-03-15
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
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你好！autodock目前为止，似乎还不能处理多个小分子的对接，要一个一个的处理，可以选择自己写脚本或者换软件对接。当然也有可能我不知道怎么对接多个。 [ 发自小木虫客户端 ] |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
watcher08212楼2015-07-22 23:58:15
3楼2015-07-24 10:52:21
watcher0821
新虫 (初入文坛)
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- 专业: 化学计量学与化学信息学
4楼2015-09-15 16:56:32
