| 查看: 3141 | 回复: 8 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
watcher0821新虫 (初入文坛)
|
[求助]
关于ZINC数据库下载小分子进行对接的问题 已有3人参与
|
||
| 我是虚拟筛选的初级选手，想请教一下有经验的大侠们，我在ZINC数据库中的lead-like和fragment-like里下载的小分子，是一个mol2文件中有无数个小分子，我提取50个小分子保存在一个mol2文件里，在AUTODOCK里面对接报错，打算对接600个小分子又不可能一个一个的保存，我是不是应该把有多个小分子的文件转化成一个文件里只有一个小分子的格式，该用什么转化怎么转换，谢谢啦~ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 autodock |
» 猜你喜欢
综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？
已经有12人回复
-
2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B?
已经有4人回复
-
应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键
已经有29人回复
-
奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样
已经有9人回复
-
是这周出结果还是下周出结果？
已经有3人回复
-
小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊
已经有9人回复
-
有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验）
已经有4人回复
-
帮忙看看fileCode
已经有13人回复
-
为什么网上很多人说本周 12号出结果
已经有7人回复
-
读博的好处
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求ZINC数据库的下载
已经有2人回复
- 【分享】mdbbs发布了三年优质资源汇总电子书
已经有48人回复
- 【分享】mdbbs发布了三年优质资源汇总电子书
已经有40人回复
zhang360
新虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1012.3
- 红花: 3
- 帖子: 687
- 在线: 82.6小时
- 虫号: 2968599
- 注册: 2014-02-14
- 专业: 中药药效物质
6楼2016-07-11 20:17:57
therotyonth
金虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2846.4
- 红花: 11
- 帖子: 957
- 在线: 68.9小时
- 虫号: 2349854
- 注册: 2013-03-15
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
|
你好！autodock目前为止，似乎还不能处理多个小分子的对接，要一个一个的处理，可以选择自己写脚本或者换软件对接。当然也有可能我不知道怎么对接多个。 [ 发自小木虫客户端 ] |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
watcher08212楼2015-07-22 23:58:15
3楼2015-07-24 10:52:21
watcher0821
新虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 233
- 散金: 60
- 帖子: 19
- 在线: 11.1小时
- 虫号: 3657110
- 注册: 2015-01-21
- 专业: 化学计量学与化学信息学
4楼2015-09-15 16:56:32
